计算机科学
計算機科學
계산궤과학
COMPUTER SCIENCE
2013年
9期
212-215,229
,共5页
程正华%张贵军%邓勇跃%金媚媚
程正華%張貴軍%鄧勇躍%金媚媚
정정화%장귀군%산용약%금미미
差分进化算法%多模态优化%空间局部原理%集结过程%能量极小化
差分進化算法%多模態優化%空間跼部原理%集結過程%能量極小化
차분진화산법%다모태우화%공간국부원리%집결과정%능량겁소화
Differential evolution%Multimodal optimization%Spatial locality%Build up procedures%Energy minimization
针对现阶段药物设计中对于蛋白质结构多模态的需求,提出了一种基于排挤差分进化策略的多模态优化算法.为了降低蛋白质构象空间求解的复杂度,算法采用能量极小化过程,有效缩小了可行域的搜索空间;同时,为了有效地平衡多模态优化问题的局部收敛性和模态多样性,在排挤差分进化算法的框架下,在保证算法收敛速度的前提下,算法采用空间局部性原理,同时随机选取不同交叉策略的集结思想又有效改善了种群的多样性.以脑啡肽为例,算法不仅得到了其全局最稳定结构,还获得了一系列局部最优结构.
針對現階段藥物設計中對于蛋白質結構多模態的需求,提齣瞭一種基于排擠差分進化策略的多模態優化算法.為瞭降低蛋白質構象空間求解的複雜度,算法採用能量極小化過程,有效縮小瞭可行域的搜索空間;同時,為瞭有效地平衡多模態優化問題的跼部收斂性和模態多樣性,在排擠差分進化算法的框架下,在保證算法收斂速度的前提下,算法採用空間跼部性原理,同時隨機選取不同交扠策略的集結思想又有效改善瞭種群的多樣性.以腦啡肽為例,算法不僅得到瞭其全跼最穩定結構,還穫得瞭一繫列跼部最優結構.
침대현계단약물설계중대우단백질결구다모태적수구,제출료일충기우배제차분진화책략적다모태우화산법.위료강저단백질구상공간구해적복잡도,산법채용능량겁소화과정,유효축소료가행역적수색공간;동시,위료유효지평형다모태우화문제적국부수렴성화모태다양성,재배제차분진화산법적광가하,재보증산법수렴속도적전제하,산법채용공간국부성원리,동시수궤선취불동교차책략적집결사상우유효개선료충군적다양성.이뇌배태위례,산법불부득도료기전국최은정결구,환획득료일계렬국부최우결구.