CAJ | 학술논문

微卫星(SSR)一般是指由单、双、三、四、五和六核苷酸重复单元串联排列的简单重复序列,它广泛分布于生物基因组内,在不同生物中,微卫星DNA的数目、类型及其分布情况存在很大的差异.本研究主要统计了已公布的灰葡萄孢基因序列中的SSR数量及类型,在灰葡萄孢的564个预测基因区域中发现669个微卫星序列,其中大多数基因(477个基因)只含有1个碱基SSR,占含SSR基因总数的71.3％；72个基因含有2个碱基SSR,13个基因含有3个碱基SSR,含4个和5个碱基SSR的基因则各只有1个.所有SSR序列中,出现数量最多的为3个碱基和6个碱基的SSR序列,分别达到了135次和330次,1个碱基、2个碱基、4个碱基和5个碱基的SSR则分别出现了7、41、64和92次.SSR碱基数越多,重复的次数越少,重复次数最少的SSR是6个碱基的AGAGGG重复.重复次数最高的SSR为122次,是3个碱基的AAT重复,这表明,在选择压力下,SSR趋向于密码子的整数倍,这与其他物种的分析结果一致.发现大多数含有SSR的基因并没有明确的功能描述,这可能是由于这些基因受到SSR的影响而在进化上变化较快所致.
미위성(SSR)일반시지유단、쌍、삼、사、오화륙핵감산중복단원천련배렬적간단중복서렬,타엄범분포우생물기인조내,재불동생물중,미위성DNA적수목、류형급기분포정황존재흔대적차이.본연구주요통계료이공포적회포도포기인서렬중적SSR수량급류형,재회포도포적564개예측기인구역중발현669개미위성서렬,기중대다수기인(477개기인)지함유1개감기SSR,점함SSR기인총수적71.3％；72개기인함유2개감기SSR,13개기인함유3개감기SSR,함4개화5개감기SSR적기인칙각지유1개.소유SSR서렬중,출현수량최다적위3개감기화6개감기적SSR서렬,분별체도료135차화330차,1개감기、2개감기、4개감기화5개감기적SSR칙분별출현료7、41、64화92차.SSR감기수월다,중복적차수월소,중복차수최소적SSR시6개감기적AGAGGG중복.중복차수최고적SSR위122차,시3개감기적AAT중복,저표명,재선택압력하,SSR추향우밀마자적정수배,저여기타물충적분석결과일치.발현대다수함유SSR적기인병몰유명학적공능묘술,저가능시유우저사기인수도SSR적영향이재진화상변화교쾌소치.