中华微生物学和免疫学杂志
中華微生物學和免疫學雜誌
중화미생물학화면역학잡지
CHINESE JOURNAL OF MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY
2014年
4期
264-268
,共5页
吴伟元%王辉%陆坚%刘映霞%卢月梅%吴劲松%李文青%程锦娥%吴文苑
吳偉元%王輝%陸堅%劉映霞%盧月梅%吳勁鬆%李文青%程錦娥%吳文苑
오위원%왕휘%륙견%류영하%로월매%오경송%리문청%정금아%오문원
伤寒沙门菌%基因分型%多位点串联重复序列分析%脉冲场凝胶电泳
傷寒沙門菌%基因分型%多位點串聯重複序列分析%脈遲場凝膠電泳
상한사문균%기인분형%다위점천련중복서렬분석%맥충장응효전영
Salmonella enterica serovar Typhi%Genotyping%Multilocus variable-number tandem-repeat analysis%Pulsed-field gel electrophoresis
目的：比较多位点串联重复序列分析（ MLVA）和脉冲场凝胶电泳（ PFGE）对伤寒沙门菌基因分型的能力，构建适合伤寒沙门菌的MLVA分型方法。方法根据国外文献报道选出5个多变的伤寒沙门菌串联重复序列（ VNTR）位点（ SAL02、SAL11、SAL16、SAL20、TR4699）设计MLVA分型方案，运用MLVA分型方案和国际PulseNet公布的沙门菌PFGE分型方案对2002至2007年21株流行病学不相关的深圳社区感染伤寒沙门菌基因分型，比较这两种分型方法对伤寒沙门菌基因分型的能力。结果5个单一VNTR位点对深圳地区伤寒沙门菌的分型能力（ D值）为0.838～0.943；使用MLVA分型方法，获得19种MLVA型别；使用PFGE分型方法，获得19种PFGE型别；两种分型方法的D值均为0.99，且结果完全一致。结论5个VNTR位点的MLVA分型方法可作为一种简单快速准确的基因分型方法用于伤寒沙门菌感染流行的分析。
目的：比較多位點串聯重複序列分析（ MLVA）和脈遲場凝膠電泳（ PFGE）對傷寒沙門菌基因分型的能力，構建適閤傷寒沙門菌的MLVA分型方法。方法根據國外文獻報道選齣5箇多變的傷寒沙門菌串聯重複序列（ VNTR）位點（ SAL02、SAL11、SAL16、SAL20、TR4699）設計MLVA分型方案，運用MLVA分型方案和國際PulseNet公佈的沙門菌PFGE分型方案對2002至2007年21株流行病學不相關的深圳社區感染傷寒沙門菌基因分型，比較這兩種分型方法對傷寒沙門菌基因分型的能力。結果5箇單一VNTR位點對深圳地區傷寒沙門菌的分型能力（ D值）為0.838～0.943；使用MLVA分型方法，穫得19種MLVA型彆；使用PFGE分型方法，穫得19種PFGE型彆；兩種分型方法的D值均為0.99，且結果完全一緻。結論5箇VNTR位點的MLVA分型方法可作為一種簡單快速準確的基因分型方法用于傷寒沙門菌感染流行的分析。
목적：비교다위점천련중복서렬분석（ MLVA）화맥충장응효전영（ PFGE）대상한사문균기인분형적능력，구건괄합상한사문균적MLVA분형방법。방법근거국외문헌보도선출5개다변적상한사문균천련중복서렬（ VNTR）위점（ SAL02、SAL11、SAL16、SAL20、TR4699）설계MLVA분형방안，운용MLVA분형방안화국제PulseNet공포적사문균PFGE분형방안대2002지2007년21주류행병학불상관적심수사구감염상한사문균기인분형，비교저량충분형방법대상한사문균기인분형적능력。결과5개단일VNTR위점대심수지구상한사문균적분형능력（ D치）위0.838～0.943；사용MLVA분형방법，획득19충MLVA형별；사용PFGE분형방법，획득19충PFGE형별；량충분형방법적D치균위0.99，차결과완전일치。결론5개VNTR위점적MLVA분형방법가작위일충간단쾌속준학적기인분형방법용우상한사문균감염류행적분석。
Objective To evaluate the capability of multilocus variable-number tandem-repeat ( VNTR) analysis ( MLVA) and pulsed-field gel electrophoresis ( PFGE) for genotyping Salmonella enterica serovar Typhi (S.Typhi) isolates.Methods Five polymorphic VNTRs (SAL02,SAL11,SAL16,SAL20, and TR4699 ) that were observed in S.Typhi strains from previous studies were selected to establish MLVA . Twenty-one epidemiologically unrelated S.Typhi strains that were isolated from Shenzhen ,China from 2002 to 2007 were genotyped by the established MLVA , and the results were compared with those by PFGE . Results The Simpson′s index of diversity ( D value ) for all five different VNTRs ranged from 0.838 to 0.943 .A total of 19 MLVA profiles and 19 PFGE profiles were found , respectively .The D value for both MLVA and PFGE were 0.99 and the test results from two analyses were identical .Conclusion The five polymorphic VNTRs analysis could be used as an alternative typing scheme for epidemiologic investigation of S.Typhi infection .
