CAJ | 학술논문

在梅山猪保种群和法系大白猪群体中采用直接测序法和PCR-RFLP法对基因VEGFA、HIF1A和EPAS1进行了基因多态位点的寻找及多态性检测并对不同基因型的总产仔数、产活仔数等繁殖性状进行了相关分析.在所获得的基因VEGFA的扩增片段中共检测到17个多态位点,其中有4个位点可进行PCR-RFLP检测,分别为BstH2I-RFLP,PspEI-RFLP,Eco32 I-RFLP和BcnI-RFLP,而在HIF1A和EPAS1扩增片段中未获得可进行PCR-RFLP检测的多态位点.在2个实验猪群中对VEGFA基因的4个多态位点进行基因型及等位基因频率分析,结果表明:VEGFA基因的BstH2I、Eco32I、PspEI 3个多态位点在梅山猪群体中A等位基因占优势,BcnI多态位点在梅山猪群体中B等位基因占优势,而在法系大白猪群体中VEGFA基因的BstH2I、Eco32I、PspEI和BcnI 4个多态位点的相关基因型和等位基因分布极不均衡.BstH2I和PspEI多态位点相关的A等位基因频率在法系大白猪群体中为0,而Eco32I和BcnI多态位点相关的A、B等位基因频率在法系大白猪群体中不到1％.单倍体型推断结果表明VEGFA基因4个多态位点在梅山猪群体中共存在10种单倍体型,而在法系大白猪群体中只存在2种单倍体型BBBA和BBAB,且只有一个个体的单倍体型是BBAB.通过性状关联分析,发现梅山猪群体中VEGFA基因单倍体型BBBA对初产总仔数影响显著(P＜0.05);单倍体型BABA对经产总仔数和经产活仔数影响显著(P＜0.05);单倍体型BBAA对初生窝重影响显著(P＜0.05).使用辐射杂种克隆板将基因VEGFA定位于SSC7q11-12;基因HIF1A定位于SSC1;基因EPAS1定位于SSC3q11-14.而所获得的基因HIF1A和EPAS1的扩增片段无PCR-RFLP可识别的SNP位点.研究结果表明猪VEGFA基因具有成为影响猪繁殖性状分子遗传标记的潜力.
재매산저보충군화법계대백저군체중채용직접측서법화PCR-RFLP법대기인VEGFA、HIF1A화EPAS1진행료기인다태위점적심조급다태성검측병대불동기인형적총산자수、산활자수등번식성상진행료상관분석.재소획득적기인VEGFA적확증편단중공검측도17개다태위점,기중유4개위점가진행PCR-RFLP검측,분별위BstH2I-RFLP,PspEI-RFLP,Eco32 I-RFLP화BcnI-RFLP,이재HIF1A화EPAS1확증편단중미획득가진행PCR-RFLP검측적다태위점.재2개실험저군중대VEGFA기인적4개다태위점진행기인형급등위기인빈솔분석,결과표명:VEGFA기인적BstH2I、Eco32I、PspEI 3개다태위점재매산저군체중A등위기인점우세,BcnI다태위점재매산저군체중B등위기인점우세,이재법계대백저군체중VEGFA기인적BstH2I、Eco32I、PspEI화BcnI 4개다태위점적상관기인형화등위기인분포겁불균형.BstH2I화PspEI다태위점상관적A등위기인빈솔재법계대백저군체중위0,이Eco32I화BcnI다태위점상관적A、B등위기인빈솔재법계대백저군체중불도1％.단배체형추단결과표명VEGFA기인4개다태위점재매산저군체중공존재10충단배체형,이재법계대백저군체중지존재2충단배체형BBBA화BBAB,차지유일개개체적단배체형시BBAB.통과성상관련분석,발현매산저군체중VEGFA기인단배체형BBBA대초산총자수영향현저(P＜0.05);단배체형BABA대경산총자수화경산활자수영향현저(P＜0.05);단배체형BBAA대초생와중영향현저(P＜0.05).사용복사잡충극륭판장기인VEGFA정위우SSC7q11-12;기인HIF1A정위우SSC1;기인EPAS1정위우SSC3q11-14.이소획득적기인HIF1A화EPAS1적확증편단무PCR-RFLP가식별적SNP위점.연구결과표명저VEGFA기인구유성위영향저번식성상분자유전표기적잠력.