实用医学杂志
實用醫學雜誌
실용의학잡지
THE JOURNAL OF PRACTICAL MEDICINE
2013年
15期
2447-2450
,共4页
廖之君%马文丽%梁爽%林德馨%王晓江%郑文岭
廖之君%馬文麗%樑爽%林德馨%王曉江%鄭文嶺
료지군%마문려%량상%림덕형%왕효강%정문령
基因表达%组织选择性,肝%loc91614基因%细胞通讯%相互作用网络
基因錶達%組織選擇性,肝%loc91614基因%細胞通訊%相互作用網絡
기인표체%조직선택성,간%loc91614기인%세포통신%상호작용망락
Gene expression%Tissue selectivity,liver%loc91614 gene%Cell communication%Interaction network
目的:预测肝脏组织选择性未知基因loc91614的功能,实验验证其基因表达.方法:构建含未知基因的肝组织选择性细胞通讯(LSCC)基因网络,再进行聚类、文献挖掘、基因本体、KEGG通路、Transfac转录因子结合位点等分析,用以预测loc91614的功能特征,最后,从mRNA和蛋白质水平验证其基因表达.结果:获得21个节点的LSCC基因网络,聚类显示loc91614与apob密切关联；文献挖掘显示基因与肝组织、胞质、脂等关键词显著相关；GO功能富集分析揭示loc91614具有细胞通讯、信号转导、细胞内信号级联的功能,有7个TFBS可对含loc91614的靶基因集进行调控,loc91614基因在肝细胞表达明显高于肝癌细胞.结论:loc91614可能分布于肝细胞的胞质中,很可能在肝组织中发挥细胞通讯等功能,也可能参与肝脏的糖、脂代谢过程,在肝细胞选择性高表达.
目的:預測肝髒組織選擇性未知基因loc91614的功能,實驗驗證其基因錶達.方法:構建含未知基因的肝組織選擇性細胞通訊(LSCC)基因網絡,再進行聚類、文獻挖掘、基因本體、KEGG通路、Transfac轉錄因子結閤位點等分析,用以預測loc91614的功能特徵,最後,從mRNA和蛋白質水平驗證其基因錶達.結果:穫得21箇節點的LSCC基因網絡,聚類顯示loc91614與apob密切關聯；文獻挖掘顯示基因與肝組織、胞質、脂等關鍵詞顯著相關；GO功能富集分析揭示loc91614具有細胞通訊、信號轉導、細胞內信號級聯的功能,有7箇TFBS可對含loc91614的靶基因集進行調控,loc91614基因在肝細胞錶達明顯高于肝癌細胞.結論:loc91614可能分佈于肝細胞的胞質中,很可能在肝組織中髮揮細胞通訊等功能,也可能參與肝髒的糖、脂代謝過程,在肝細胞選擇性高錶達.
목적:예측간장조직선택성미지기인loc91614적공능,실험험증기기인표체.방법:구건함미지기인적간조직선택성세포통신(LSCC)기인망락,재진행취류、문헌알굴、기인본체、KEGG통로、Transfac전록인자결합위점등분석,용이예측loc91614적공능특정,최후,종mRNA화단백질수평험증기기인표체.결과:획득21개절점적LSCC기인망락,취류현시loc91614여apob밀절관련；문헌알굴현시기인여간조직、포질、지등관건사현저상관；GO공능부집분석게시loc91614구유세포통신、신호전도、세포내신호급련적공능,유7개TFBS가대함loc91614적파기인집진행조공,loc91614기인재간세포표체명현고우간암세포.결론:loc91614가능분포우간세포적포질중,흔가능재간조직중발휘세포통신등공능,야가능삼여간장적당、지대사과정,재간세포선택성고표체.
