临床肿瘤学杂志
臨床腫瘤學雜誌
림상종류학잡지
CHINESE CLINICAL ONCOLOGY
2013年
10期
882-886
,共5页
曹伟军%吴海露%张予蜀%陈震球%袁捷%张振玉
曹偉軍%吳海露%張予蜀%陳震毬%袁捷%張振玉
조위군%오해로%장여촉%진진구%원첩%장진옥
结肠癌%长链非编码RNA%基因芯片
結腸癌%長鏈非編碼RNA%基因芯片
결장암%장련비편마RNA%기인심편
Colon carcinoma%Long non-coding RNA (lncRNA)%Gene microarray
目的 探讨长链非编码RNA (lncRNA)在结肠癌中的表达情况.方法 从公共数据平台Gene ExpressionOmnibus (GEO)下载结肠癌外显子芯片数据集GSE31737,包含40对结肠癌及癌旁组织.对外显子芯片探针进行重排,筛选出在基因水平特异性匹配lncRNA的探针.用Affymetrix Power Tools分析获得lncRNA表达谱,用LIMMA分析在结肠癌和癌旁组织中差异表达的lncRNA.结果 共有136 053个探针特异性匹配9294个lncRNA,约包含了Ensembl数据库中76％的ln-cRNA.分析GSE31737发现,与癌旁组织相比,结肠癌组织中共有87个lncRNA差异表达,其中50个高表达,37个低表达.结肠癌与癌旁组织表达值倍数变化＞1.5倍的基因共37个.结论 lncRNA表达在结肠癌组织中发生明显变化,有可能成为结肠癌的分子诊断和基因治疗的新靶点.
目的 探討長鏈非編碼RNA (lncRNA)在結腸癌中的錶達情況.方法 從公共數據平檯Gene ExpressionOmnibus (GEO)下載結腸癌外顯子芯片數據集GSE31737,包含40對結腸癌及癌徬組織.對外顯子芯片探針進行重排,篩選齣在基因水平特異性匹配lncRNA的探針.用Affymetrix Power Tools分析穫得lncRNA錶達譜,用LIMMA分析在結腸癌和癌徬組織中差異錶達的lncRNA.結果 共有136 053箇探針特異性匹配9294箇lncRNA,約包含瞭Ensembl數據庫中76％的ln-cRNA.分析GSE31737髮現,與癌徬組織相比,結腸癌組織中共有87箇lncRNA差異錶達,其中50箇高錶達,37箇低錶達.結腸癌與癌徬組織錶達值倍數變化＞1.5倍的基因共37箇.結論 lncRNA錶達在結腸癌組織中髮生明顯變化,有可能成為結腸癌的分子診斷和基因治療的新靶點.
목적 탐토장련비편마RNA (lncRNA)재결장암중적표체정황.방법 종공공수거평태Gene ExpressionOmnibus (GEO)하재결장암외현자심편수거집GSE31737,포함40대결장암급암방조직.대외현자심편탐침진행중배,사선출재기인수평특이성필배lncRNA적탐침.용Affymetrix Power Tools분석획득lncRNA표체보,용LIMMA분석재결장암화암방조직중차이표체적lncRNA.결과 공유136 053개탐침특이성필배9294개lncRNA,약포함료Ensembl수거고중76％적ln-cRNA.분석GSE31737발현,여암방조직상비,결장암조직중공유87개lncRNA차이표체,기중50개고표체,37개저표체.결장암여암방조직표체치배수변화＞1.5배적기인공37개.결론 lncRNA표체재결장암조직중발생명현변화,유가능성위결장암적분자진단화기인치료적신파점.
