海南医学
海南醫學
해남의학
HAINAN MEDICAL JOURNAL
2013年
20期
2965-2967
,共3页
张国如%王晋%王姚斐%陈运崇%杜秀藩
張國如%王晉%王姚斐%陳運崇%杜秀藩
장국여%왕진%왕요비%진운숭%두수번
Ezrin%靶点%DNAzymes%二级结构
Ezrin%靶點%DNAzymes%二級結構
Ezrin%파점%DNAzymes%이급결구
ezrin%Target site%DNAzymes%Secondary structure
目的 对Ezrin mRNA的4个DNAzymes靶点AU1655、AU1751、AU1766、AU1789通过体外实验进行验证,寻找最佳的作用位点.方法 同时使用RNAdraw、RNAstructure和OligoWalk 3个程序对Ezrin mRNA的DNAzymes靶点进行了设计和筛选,对最终选出的4个位点AU1655、AU1751、AU1766、AU1789进行实验研究.结果 4个DNAzymes分别命名为Dz1655、Dz1751、Dz1766和Dz1789,酶切反应结果只有Dz1751在预期的位点成功切割了ezrin全长的mRNA,得到了128 bp和1633 bp两个片段,其他3个DNAzymes均未能有效地完成切割;反应后所剩留底物RNA中位点AU1751最少,位点AU1751是DNAzymes切割ezrin mRNA的最佳位点.结论 核酸二级结构联合热动力学参数可以最大程度预测和设计DNAzymes针对ezrin mRNA的作用位点.
目的 對Ezrin mRNA的4箇DNAzymes靶點AU1655、AU1751、AU1766、AU1789通過體外實驗進行驗證,尋找最佳的作用位點.方法 同時使用RNAdraw、RNAstructure和OligoWalk 3箇程序對Ezrin mRNA的DNAzymes靶點進行瞭設計和篩選,對最終選齣的4箇位點AU1655、AU1751、AU1766、AU1789進行實驗研究.結果 4箇DNAzymes分彆命名為Dz1655、Dz1751、Dz1766和Dz1789,酶切反應結果隻有Dz1751在預期的位點成功切割瞭ezrin全長的mRNA,得到瞭128 bp和1633 bp兩箇片段,其他3箇DNAzymes均未能有效地完成切割;反應後所剩留底物RNA中位點AU1751最少,位點AU1751是DNAzymes切割ezrin mRNA的最佳位點.結論 覈痠二級結構聯閤熱動力學參數可以最大程度預測和設計DNAzymes針對ezrin mRNA的作用位點.
목적 대Ezrin mRNA적4개DNAzymes파점AU1655、AU1751、AU1766、AU1789통과체외실험진행험증,심조최가적작용위점.방법 동시사용RNAdraw、RNAstructure화OligoWalk 3개정서대Ezrin mRNA적DNAzymes파점진행료설계화사선,대최종선출적4개위점AU1655、AU1751、AU1766、AU1789진행실험연구.결과 4개DNAzymes분별명명위Dz1655、Dz1751、Dz1766화Dz1789,매절반응결과지유Dz1751재예기적위점성공절할료ezrin전장적mRNA,득도료128 bp화1633 bp량개편단,기타3개DNAzymes균미능유효지완성절할;반응후소잉류저물RNA중위점AU1751최소,위점AU1751시DNAzymes절할ezrin mRNA적최가위점.결론 핵산이급결구연합열동역학삼수가이최대정도예측화설계DNAzymes침대ezrin mRNA적작용위점.