动物营养学报
動物營養學報
동물영양학보
ACTA ZOONUTRIMENTA SINICA
2013年
10期
2504-2508
,共5页
周建波%姜亚%宁俊平%曹晓燕%黄怡%王士长
週建波%薑亞%寧俊平%曹曉燕%黃怡%王士長
주건파%강아%저준평%조효연%황이%왕사장
竹鼠%16S rDNA%ARDRA%克隆
竹鼠%16S rDNA%ARDRA%剋隆
죽서%16S rDNA%ARDRA%극륭
bamboo rat%16S rDNA%ARDRA%clone
本试验应用扩增性rDNA限制性酶切片段多态性分析(ARDRA)技术研究竹鼠盲肠细菌菌群的多样性.利用免培养的分子生物学技术,从竹鼠盲肠内容物中提取细菌的总DNA,用细菌通用引物F27/R1492扩增出细菌16S rDNA的基因,构建16S rDNA基因文库.采用HaeⅢ和HhaⅠ 2种限制性内切酶对阳性克隆子的扩增产物进行酶切,挑选不同的操作分类单元(OTU)测序,通过Blast在线比对,分析竹鼠盲肠细菌菌群的多样性.结果表明:竹鼠盲肠中的细菌菌群大部分是未培养或未知的菌株,在分类学上具有潜在意义的被选菌株,而且存在可能和脂肪代谢有关的微生物群体.同时也有乳酸菌属、芽孢杆菌属、梭形杆菌属和多黏类芽孢杆菌属的分布.从结果中看出,芽孢杆菌属、梭形杆菌属和2个未知菌株的克隆数都大于20个,是优势菌株.
本試驗應用擴增性rDNA限製性酶切片段多態性分析(ARDRA)技術研究竹鼠盲腸細菌菌群的多樣性.利用免培養的分子生物學技術,從竹鼠盲腸內容物中提取細菌的總DNA,用細菌通用引物F27/R1492擴增齣細菌16S rDNA的基因,構建16S rDNA基因文庫.採用HaeⅢ和HhaⅠ 2種限製性內切酶對暘性剋隆子的擴增產物進行酶切,挑選不同的操作分類單元(OTU)測序,通過Blast在線比對,分析竹鼠盲腸細菌菌群的多樣性.結果錶明:竹鼠盲腸中的細菌菌群大部分是未培養或未知的菌株,在分類學上具有潛在意義的被選菌株,而且存在可能和脂肪代謝有關的微生物群體.同時也有乳痠菌屬、芽孢桿菌屬、梭形桿菌屬和多黏類芽孢桿菌屬的分佈.從結果中看齣,芽孢桿菌屬、梭形桿菌屬和2箇未知菌株的剋隆數都大于20箇,是優勢菌株.
본시험응용확증성rDNA한제성매절편단다태성분석(ARDRA)기술연구죽서맹장세균균군적다양성.이용면배양적분자생물학기술,종죽서맹장내용물중제취세균적총DNA,용세균통용인물F27/R1492확증출세균16S rDNA적기인,구건16S rDNA기인문고.채용HaeⅢ화HhaⅠ 2충한제성내절매대양성극륭자적확증산물진행매절,도선불동적조작분류단원(OTU)측서,통과Blast재선비대,분석죽서맹장세균균군적다양성.결과표명:죽서맹장중적세균균군대부분시미배양혹미지적균주,재분류학상구유잠재의의적피선균주,이차존재가능화지방대사유관적미생물군체.동시야유유산균속、아포간균속、사형간균속화다점류아포간균속적분포.종결과중간출,아포간균속、사형간균속화2개미지균주적극륭수도대우20개,시우세균주.
