南京林业大学学报(自然科学版)
南京林業大學學報(自然科學版)
남경임업대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF NANJING FORESTRY UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE EDITION)
2014年
1期
15-20
,共6页
王新民%郑仁华%陈金慧%赵亚琦%徐阳%王颖%施季森
王新民%鄭仁華%陳金慧%趙亞琦%徐暘%王穎%施季森
왕신민%정인화%진금혜%조아기%서양%왕영%시계삼
杉木%SRAP-PCR%体系优化
杉木%SRAP-PCR%體繫優化
삼목%SRAP-PCR%체계우화
Chinese fir%SRAP-PCR%system optimization
为建立杉木SRAP-PCR反应体系,利用L16(45)正交设计对影响杉木SRAP-PCR反应体系的Mg2+、dNTPs、引物、Taq酶和DNA浓度5种因素的4个水平进行优化实验,结合正交直观分析和方差分析,对影响反应较大的Mg2+、dNTPs和引物浓度进行单因素实验,最终确定杉木SRAP-PCR最佳的反应体系为:在20μL的PCR反应体系中,Mg2+浓度为2.25 mmol/L、dNTPs为0.15 mmol/L、引物浓度为0.4μmol/L、Taq酶为1.5μmol/min、模板DNA为60 ng,10×PCR Buffer 2μL,不足部分用双蒸水补充至20μL。 PCR反应程序的两步最适退火温度第1步为35℃,第2步为53℃。利用上述反应体系进行杉木PCR扩增,能得到清晰、稳定的条带。
為建立杉木SRAP-PCR反應體繫,利用L16(45)正交設計對影響杉木SRAP-PCR反應體繫的Mg2+、dNTPs、引物、Taq酶和DNA濃度5種因素的4箇水平進行優化實驗,結閤正交直觀分析和方差分析,對影響反應較大的Mg2+、dNTPs和引物濃度進行單因素實驗,最終確定杉木SRAP-PCR最佳的反應體繫為:在20μL的PCR反應體繫中,Mg2+濃度為2.25 mmol/L、dNTPs為0.15 mmol/L、引物濃度為0.4μmol/L、Taq酶為1.5μmol/min、模闆DNA為60 ng,10×PCR Buffer 2μL,不足部分用雙蒸水補充至20μL。 PCR反應程序的兩步最適退火溫度第1步為35℃,第2步為53℃。利用上述反應體繫進行杉木PCR擴增,能得到清晰、穩定的條帶。
위건립삼목SRAP-PCR반응체계,이용L16(45)정교설계대영향삼목SRAP-PCR반응체계적Mg2+、dNTPs、인물、Taq매화DNA농도5충인소적4개수평진행우화실험,결합정교직관분석화방차분석,대영향반응교대적Mg2+、dNTPs화인물농도진행단인소실험,최종학정삼목SRAP-PCR최가적반응체계위:재20μL적PCR반응체계중,Mg2+농도위2.25 mmol/L、dNTPs위0.15 mmol/L、인물농도위0.4μmol/L、Taq매위1.5μmol/min、모판DNA위60 ng,10×PCR Buffer 2μL,불족부분용쌍증수보충지20μL。 PCR반응정서적량보최괄퇴화온도제1보위35℃,제2보위53℃。이용상술반응체계진행삼목PCR확증,능득도청석、은정적조대。
In order to optimize SRAP-PCR reaction system for Chinese fir,the orthogonal design L16(45) was considered with different concentrations of Mg2+, dNTPs, primer, Taq DNA polymerase and DNA template in SRAP-PCR reaction system for Chinese fir. The results of PCR were evaluated by visual and variance analysis,then the concentrations of Mg2+, dNTPs,primer were rectified with single-factor design. Finally,the results showed that the best reaction system was the combination in 20μL reaction solution,containing of Mg2+ 2.25 mmol/L,dNTPs 0.15 mmol/L,primer 0.4 μmol/L,Taq DNA polymerase1.5μmol/min and DNA template 60 ng,2μL10×PCR Buffer and ddH2 O to 20μL. The first optimal an-nealing temperature was 35℃,and the second step was 53 ℃. The optimized reaction system of Chinese fir described a-bove can get clear and stable bands.