南方农业学报
南方農業學報
남방농업학보
GUANGXI AGRICULTURAL SCIENCES
2013年
11期
1757-1764
,共8页
甘蔗%14-3-3基因%聚类分析%蛋白结构%表达%实时定量PCR
甘蔗%14-3-3基因%聚類分析%蛋白結構%錶達%實時定量PCR
감자%14-3-3기인%취류분석%단백결구%표체%실시정량PCR
sugarcane%14-3-3 gene%cluster analysis%protein structure%expression%real-time quantitative PCR
[目的]克隆甘蔗14-3-3基因并预测分析其编码蛋白的结构,为研究甘蔗基因功能和代谢调控机制提供参考.[方法]以水稻14-3-3基因为模板,BLAST甘蔗EST数据库,依据序列拼接结果及RT-PCR技术获得编码甘蔗14-3-3蛋白的全长基因,并用生物信息学方法对该蛋白的二级、高级结构和功能活性位点进行预测.[结果]克隆得到长784bp的甘蔗14-3-3基因,最大开放阅读框为771 bp,编码256个氨基酸;该蛋白的分子量与理论等电点分别为28.88 kDa和4.79.蛋白聚类分析结果表明,甘蔗14-3-3蛋白与水稻、高粱、玉米14-3-3蛋白的同源性均在90%以上.Cn3D V.4.1预测位于第3和第5两个二聚体上的Lys-50、Arg-57、Arg-131和Try-132组成一个凹穴,是结合靶蛋白的作用面;第60、65、188、218位的4个丝氨酸是磷酸化的活性位点.实时定量PCR检测结果表明,14-3-3基因在甘蔗不同组织中均有表达,在茎和分生组织中14-3-3基因高丰度表达,可能与糖代谢和细胞分裂的调控相关;而在根中可能参与矿物元素的吸收和代谢.[结论]甘蔗14-3-3基因可作为信号转导调控蛋白的候选基因之一.
[目的]剋隆甘蔗14-3-3基因併預測分析其編碼蛋白的結構,為研究甘蔗基因功能和代謝調控機製提供參攷.[方法]以水稻14-3-3基因為模闆,BLAST甘蔗EST數據庫,依據序列拼接結果及RT-PCR技術穫得編碼甘蔗14-3-3蛋白的全長基因,併用生物信息學方法對該蛋白的二級、高級結構和功能活性位點進行預測.[結果]剋隆得到長784bp的甘蔗14-3-3基因,最大開放閱讀框為771 bp,編碼256箇氨基痠;該蛋白的分子量與理論等電點分彆為28.88 kDa和4.79.蛋白聚類分析結果錶明,甘蔗14-3-3蛋白與水稻、高粱、玉米14-3-3蛋白的同源性均在90%以上.Cn3D V.4.1預測位于第3和第5兩箇二聚體上的Lys-50、Arg-57、Arg-131和Try-132組成一箇凹穴,是結閤靶蛋白的作用麵;第60、65、188、218位的4箇絲氨痠是燐痠化的活性位點.實時定量PCR檢測結果錶明,14-3-3基因在甘蔗不同組織中均有錶達,在莖和分生組織中14-3-3基因高豐度錶達,可能與糖代謝和細胞分裂的調控相關;而在根中可能參與礦物元素的吸收和代謝.[結論]甘蔗14-3-3基因可作為信號轉導調控蛋白的候選基因之一.
[목적]극륭감자14-3-3기인병예측분석기편마단백적결구,위연구감자기인공능화대사조공궤제제공삼고.[방법]이수도14-3-3기인위모판,BLAST감자EST수거고,의거서렬병접결과급RT-PCR기술획득편마감자14-3-3단백적전장기인,병용생물신식학방법대해단백적이급、고급결구화공능활성위점진행예측.[결과]극륭득도장784bp적감자14-3-3기인,최대개방열독광위771 bp,편마256개안기산;해단백적분자량여이론등전점분별위28.88 kDa화4.79.단백취류분석결과표명,감자14-3-3단백여수도、고량、옥미14-3-3단백적동원성균재90%이상.Cn3D V.4.1예측위우제3화제5량개이취체상적Lys-50、Arg-57、Arg-131화Try-132조성일개요혈,시결합파단백적작용면;제60、65、188、218위적4개사안산시린산화적활성위점.실시정량PCR검측결과표명,14-3-3기인재감자불동조직중균유표체,재경화분생조직중14-3-3기인고봉도표체,가능여당대사화세포분렬적조공상관;이재근중가능삼여광물원소적흡수화대사.[결론]감자14-3-3기인가작위신호전도조공단백적후선기인지일.