华北农学报
華北農學報
화북농학보
ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA
2013年
z1期
97-102
,共6页
贾秋磊%王林%陈鹏%杨青%姜秀萍
賈鞦磊%王林%陳鵬%楊青%薑秀萍
가추뢰%왕림%진붕%양청%강수평
降纤酶%免疫原性%线性表位%构象型表位%同源模建%长白山白眉蝮蛇
降纖酶%免疫原性%線性錶位%構象型錶位%同源模建%長白山白眉蝮蛇
강섬매%면역원성%선성표위%구상형표위%동원모건%장백산백미복사
Defibrase%Immunogenicity%Linear epitopes%Conformational eptiopes%Homology modeling%Agkistr-odon halys ussuriensis
白眉蝮蛇降纤酶是我国在临床上用来治疗血栓栓塞性疾病的国家基本药物。但该酶来源于蛇毒，是异源蛋白，且是大分子蛋白质，不可避免的存在免疫原性问题。另外该蛋白药物在我国使用规模很大，因此由免疫原性导致的安全性问题不容忽视。首先通过DNAStar软件和ABCpred、BCPREDS等服务器预测得到肽端AA27～35、44～50、66～72、79～98、101～109、117～127、134～142、151～164、179～188、194～206、221～233、247～260区域为白眉蝮蛇降纤酶的B细胞线性表位优势区域。然后以蝮蛇毒蛋白C激活剂蛋白的晶体结构为模板，利用MODELLER 9.10软件中的Pythonwin程序进行白眉蝮蛇降纤酶的同源模建，并利用PROCHECK、ERRAT及PROSA程序进行同源模建的合理化评价。根据白眉蝮蛇降纤酶的模建三维结构并结合DiscoTope和cons PPISP网络数据库预测B细胞构象型抗原表位。得到蛋白的N端45～51、81～90、95～106、134～141、153～159、177～182、225～232、251～257区段为白眉蝮蛇降纤酶的B细胞构象型表位区域。本项目的预期成果将为降纤酶药物的安全化应用提供新思路，为蛋白质药物免疫原性机制研究提供技术基础。
白眉蝮蛇降纖酶是我國在臨床上用來治療血栓栓塞性疾病的國傢基本藥物。但該酶來源于蛇毒，是異源蛋白，且是大分子蛋白質，不可避免的存在免疫原性問題。另外該蛋白藥物在我國使用規模很大，因此由免疫原性導緻的安全性問題不容忽視。首先通過DNAStar軟件和ABCpred、BCPREDS等服務器預測得到肽耑AA27～35、44～50、66～72、79～98、101～109、117～127、134～142、151～164、179～188、194～206、221～233、247～260區域為白眉蝮蛇降纖酶的B細胞線性錶位優勢區域。然後以蝮蛇毒蛋白C激活劑蛋白的晶體結構為模闆，利用MODELLER 9.10軟件中的Pythonwin程序進行白眉蝮蛇降纖酶的同源模建，併利用PROCHECK、ERRAT及PROSA程序進行同源模建的閤理化評價。根據白眉蝮蛇降纖酶的模建三維結構併結閤DiscoTope和cons PPISP網絡數據庫預測B細胞構象型抗原錶位。得到蛋白的N耑45～51、81～90、95～106、134～141、153～159、177～182、225～232、251～257區段為白眉蝮蛇降纖酶的B細胞構象型錶位區域。本項目的預期成果將為降纖酶藥物的安全化應用提供新思路，為蛋白質藥物免疫原性機製研究提供技術基礎。
백미복사강섬매시아국재림상상용래치료혈전전새성질병적국가기본약물。단해매래원우사독，시이원단백，차시대분자단백질，불가피면적존재면역원성문제。령외해단백약물재아국사용규모흔대，인차유면역원성도치적안전성문제불용홀시。수선통과DNAStar연건화ABCpred、BCPREDS등복무기예측득도태단AA27～35、44～50、66～72、79～98、101～109、117～127、134～142、151～164、179～188、194～206、221～233、247～260구역위백미복사강섬매적B세포선성표위우세구역。연후이복사독단백C격활제단백적정체결구위모판，이용MODELLER 9.10연건중적Pythonwin정서진행백미복사강섬매적동원모건，병이용PROCHECK、ERRAT급PROSA정서진행동원모건적합이화평개。근거백미복사강섬매적모건삼유결구병결합DiscoTope화cons PPISP망락수거고예측B세포구상형항원표위。득도단백적N단45～51、81～90、95～106、134～141、153～159、177～182、225～232、251～257구단위백미복사강섬매적B세포구상형표위구역。본항목적예기성과장위강섬매약물적안전화응용제공신사로，위단백질약물면역원성궤제연구제공기술기출。
Defibrase from Agkistrodon halys ussuriensis snake venom is essential medicine to be used in the clinical treatment of thromboembilic disease in our country .However,this enzyme derived from snake venom ,is a heterologous protein and is a macromolecular protein ,and therefore ,it's immunogenicity problem is inevitable .More-over,this protein drug was used in large scale in our country ,and therefore,the security issues caused by immunoge-nicity cannot be ignored .In this work,B cell linear epitopes were predicted using DNAStar soft ware and ABCpred , BCPREDS,BcePred,BepiPred 1.0 and Ellipro web servers.B-cell linear epitopes in defibrase were predicted to lo-cate in the regions of 27-35,44-50,66-72,79-98,101-109,117-127,134-142,151-164,179-188,194-206,221-233 and 247-260.Using protein C activator from Agkistrodon contortrix venom(ACC-C) as template,a 3D structure model of defibrase was constructed by Pythonwin program using modeling package MODELLER 9 .10 .Ste-reochemical quality of the selected model was evaluated using PROCHECK ,Errat and PROSA programs .The confor-mational epitopes of defibrase was predicted by 3D structure of homology modeling combined with Discotope 1.2 server and cons PPISP online tools .B-cell conformational epitopes in defibrase were predicted to locate in the re-gions of 45-51 ,81-90 ,95-106 ,134-141 ,153-159 ,177-182 ,225-232 and 251-257 .The expected results of the project are useful for providing new ideas for the safety applications of defibrase drugs ,and providing the tech-nical basis for immunogenicity mechanism of protein drugs .
