中国人兽共患病学报
中國人獸共患病學報
중국인수공환병학보
CHINESE JOURNAL OF ZOONOSES
2013年
12期
1137-1142
,共6页
孙晖%白向宁%赵爱兰%孟琼%熊衍文%卢珊
孫暉%白嚮寧%趙愛蘭%孟瓊%熊衍文%盧珊
손휘%백향저%조애란%맹경%웅연문%로산
产志贺毒素大肠杆菌%多位点序列分型%序列型%牦牛
產誌賀毒素大腸桿菌%多位點序列分型%序列型%牦牛
산지하독소대장간균%다위점서렬분형%서렬형%모우
Shiga toxin producing Escherichia coli%multilocus sequence typing%sequence type%yak
目的 对牦牛携带的产志贺毒素大肠杆菌(Shiga toxin-producing Escherichia coli,STEC)进行多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)分析,了解菌株的遗传进化关系及致病潜力.方法 根据E.coli MLST数据库(http://mlst.ucc.ie/mlst/dbs/Ecoli)提供的MLST方案,对青海玉树牦牛中分离的54株STEC分离株的7个管家基因进行PCR扩增并测序,通过序列比对确定其等位基因及菌株序列型(Sequence type,ST),并使用BioNumeries软件构建最小生成树(Minimum spanning tree,MST),分析牦牛ST型与HUSEC及人源主要流行血清群STEC菌株ST型间的进化关系.结果 54株牦牛STEC菌株呈现高度遗传多态性,可分为31个ST型别,其中包括7个新的等位基因型和17个新的ST型,并存在与HUSEC及主要流行血清群STEC亲缘关系相同或相近的ST型别.结论 青藏高原牦牛携带的STEC具有遗传多样性及一定的特异性,部分菌株具有对人致病的潜力.
目的 對牦牛攜帶的產誌賀毒素大腸桿菌(Shiga toxin-producing Escherichia coli,STEC)進行多位點序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)分析,瞭解菌株的遺傳進化關繫及緻病潛力.方法 根據E.coli MLST數據庫(http://mlst.ucc.ie/mlst/dbs/Ecoli)提供的MLST方案,對青海玉樹牦牛中分離的54株STEC分離株的7箇管傢基因進行PCR擴增併測序,通過序列比對確定其等位基因及菌株序列型(Sequence type,ST),併使用BioNumeries軟件構建最小生成樹(Minimum spanning tree,MST),分析牦牛ST型與HUSEC及人源主要流行血清群STEC菌株ST型間的進化關繫.結果 54株牦牛STEC菌株呈現高度遺傳多態性,可分為31箇ST型彆,其中包括7箇新的等位基因型和17箇新的ST型,併存在與HUSEC及主要流行血清群STEC親緣關繫相同或相近的ST型彆.結論 青藏高原牦牛攜帶的STEC具有遺傳多樣性及一定的特異性,部分菌株具有對人緻病的潛力.
목적 대모우휴대적산지하독소대장간균(Shiga toxin-producing Escherichia coli,STEC)진행다위점서렬분형(Multilocus sequence typing,MLST)분석,료해균주적유전진화관계급치병잠력.방법 근거E.coli MLST수거고(http://mlst.ucc.ie/mlst/dbs/Ecoli)제공적MLST방안,대청해옥수모우중분리적54주STEC분리주적7개관가기인진행PCR확증병측서,통과서렬비대학정기등위기인급균주서렬형(Sequence type,ST),병사용BioNumeries연건구건최소생성수(Minimum spanning tree,MST),분석모우ST형여HUSEC급인원주요류행혈청군STEC균주ST형간적진화관계.결과 54주모우STEC균주정현고도유전다태성,가분위31개ST형별,기중포괄7개신적등위기인형화17개신적ST형,병존재여HUSEC급주요류행혈청군STEC친연관계상동혹상근적ST형별.결론 청장고원모우휴대적STEC구유유전다양성급일정적특이성,부분균주구유대인치병적잠력.