基于时序表达谱芯片挖掘鸡脂肪酸代谢关键调控基因
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Mining Key Genes of Chicken Fatty Acid Metabolism Based on Time Series Microarray
  • 万方数据
    畜牧兽医学报 축목수의학보

    2013年 12期 1882-1890 ,共9页

    王洪志%常国斌%马腾%翟飞%夏明秀%刘璐%陈静%徐璐%陈国宏

    왕홍지%상국빈%마등%적비%하명수%류로%진정%서로%진국굉

    脂肪酸%表达谱芯片%节点基因%调控通路 脂肪痠%錶達譜芯片%節點基因%調控通路
    지방산%표체보심편%절점기인%조공통로
    fatty acid(FA)%microarray%node gene%regulatory pathway
    不同脂肪酸的代谢产物决定了鸡肉风味的差异,找出影响鸡肌肉组织中脂肪酸代谢的关键调控基因对提高肉品质以及对优质肉鸡新品系选育具有重要意义.本研究对KEGG和Wikipathway数据库中脂肪酸代谢网络进行整合分析,挖掘鸡脂肪酸代谢的关键基因,通过Gene Spring筛选出不同周龄的肌肉组织中表达谱芯片与关键基因共表达的差异基因(Pearson相关系数≥0.9),然后导入Cytoscape进行共表达网络分析,最后进行跨物种检索关键调控基因功能,得到鸡肌肉组织中脂肪酸代谢的节点基因和相关通路.结果表明,Ep300、Traf2和Pak1等基因是影响鸡肌肉中脂肪酸代谢的节点基因,MAPK通路、ErbB通路和Herpes simplex infection通路可能是肌肉中脂肪酸代谢调控的关键通路,该结果为研究家禽肌肉中脂肪酸代谢的分子机制和进一步筛选优质肉质基因提供了基础资料.
    불동지방산적대사산물결정료계육풍미적차이,조출영향계기육조직중지방산대사적관건조공기인대제고육품질이급대우질육계신품계선육구유중요의의.본연구대KEGG화Wikipathway수거고중지방산대사망락진행정합분석,알굴계지방산대사적관건기인,통과Gene Spring사선출불동주령적기육조직중표체보심편여관건기인공표체적차이기인(Pearson상관계수≥0.9),연후도입Cytoscape진행공표체망락분석,최후진행과물충검색관건조공기인공능,득도계기육조직중지방산대사적절점기인화상관통로.결과표명,Ep300、Traf2화Pak1등기인시영향계기육중지방산대사적절점기인,MAPK통로、ErbB통로화Herpes simplex infection통로가능시기육중지방산대사조공적관건통로,해결과위연구가금기육중지방산대사적분자궤제화진일보사선우질육질기인제공료기출자료.
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