中国家禽
中國傢禽
중국가금
CHINA POULTRY
2013年
24期
11-15
,共5页
黄种彬%张扬%江宵兵%钟志新%徐琪%陈国宏
黃種彬%張颺%江宵兵%鐘誌新%徐琪%陳國宏
황충빈%장양%강소병%종지신%서기%진국굉
鸭%微卫星标记%群体结构%主成分分析%Structure程序
鴨%微衛星標記%群體結構%主成分分析%Structure程序
압%미위성표기%군체결구%주성분분석%Structure정서
为深入研究福建省地方鸭品种的群体遗传结构,本研究利用经过筛选验证的荧光标记微卫星引物结合ABI-3730XL型DNA测序平台,对连城白鸭、莆田黑鸭、金定鸭、山麻鸭和福建番鸭等5个品种共计464个个体在12个位点上的等位基因进行STR分型,分别利用SPSS 19.0和Structure2.0软件对群体结构进行分析.结果显示:12个座位的多态性丰富,共检测到81个等位基因,PCA分析得到4个主成分,前3个主成分对群体分类的累积贡献率达到85.904％.Structure程序成功构建出了5个群体的遗传分化结构图和群体的独立类群分布图,推断5个群体在所属推断类别中的平均基因组分数分别为94.7％、95.9％、92.4％、93.3％、97.8％;且只有4个个体发生了迁移. Structure程序构建的系统发育树显示4个河鸭属品种遗传距离较近,与福建番鸭亲缘关系较远;山麻鸭与金定鸭、莆田黑鸭与连城白鸭各自聚类后,再与福建番鸭聚类.
為深入研究福建省地方鴨品種的群體遺傳結構,本研究利用經過篩選驗證的熒光標記微衛星引物結閤ABI-3730XL型DNA測序平檯,對連城白鴨、莆田黑鴨、金定鴨、山痳鴨和福建番鴨等5箇品種共計464箇箇體在12箇位點上的等位基因進行STR分型,分彆利用SPSS 19.0和Structure2.0軟件對群體結構進行分析.結果顯示:12箇座位的多態性豐富,共檢測到81箇等位基因,PCA分析得到4箇主成分,前3箇主成分對群體分類的纍積貢獻率達到85.904％.Structure程序成功構建齣瞭5箇群體的遺傳分化結構圖和群體的獨立類群分佈圖,推斷5箇群體在所屬推斷類彆中的平均基因組分數分彆為94.7％、95.9％、92.4％、93.3％、97.8％;且隻有4箇箇體髮生瞭遷移. Structure程序構建的繫統髮育樹顯示4箇河鴨屬品種遺傳距離較近,與福建番鴨親緣關繫較遠;山痳鴨與金定鴨、莆田黑鴨與連城白鴨各自聚類後,再與福建番鴨聚類.
위심입연구복건성지방압품충적군체유전결구,본연구이용경과사선험증적형광표기미위성인물결합ABI-3730XL형DNA측서평태,대련성백압、보전흑압、금정압、산마압화복건번압등5개품충공계464개개체재12개위점상적등위기인진행STR분형,분별이용SPSS 19.0화Structure2.0연건대군체결구진행분석.결과현시:12개좌위적다태성봉부,공검측도81개등위기인,PCA분석득도4개주성분,전3개주성분대군체분류적루적공헌솔체도85.904％.Structure정서성공구건출료5개군체적유전분화결구도화군체적독립류군분포도,추단5개군체재소속추단유별중적평균기인조분수분별위94.7％、95.9％、92.4％、93.3％、97.8％;차지유4개개체발생료천이. Structure정서구건적계통발육수현시4개하압속품충유전거리교근,여복건번압친연관계교원;산마압여금정압、보전흑압여련성백압각자취류후,재여복건번압취류.
