安徽农业科学
安徽農業科學
안휘농업과학
JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES
2013年
28期
11286-11288,11319
,共4页
阳永学%程维舜%曾红霞%张娜%施先锋%孙玉宏
暘永學%程維舜%曾紅霞%張娜%施先鋒%孫玉宏
양영학%정유순%증홍하%장나%시선봉%손옥굉
西瓜%ClCP1%基因克隆%生物信息学
西瓜%ClCP1%基因剋隆%生物信息學
서과%ClCP1%기인극륭%생물신식학
Watermelon%ClCP1%Gene cloning%Bioinformatics
[目的]克隆西瓜半胱氨酸蛋白酶基因ClCP1,并对其进行生物信息学分析.[方法]以西瓜花蕾cDNA为模板,借助西瓜全基因组数据库,采用RT-PCR方法对西瓜半胱氨酸蛋白酶基因进行克隆并进行生物信息学分析.[结果]克隆得到一个开放阅读框长度为960bp的序列,命名为ClCP1.该基因编码319个氨基酸.ClCP1基因的保守结构域分析结果表明,ClCP1属于木瓜蛋白酶家族基因,与已知其他植物半胱氨酸蛋白酶在氨基酸序列上有56％ ～ 85％的相似性.聚类分析结果显示,ClCP1与同为葫芦科的黄瓜CP基因亲缘关系较近.[结论] ClCP1属于西瓜木瓜蛋白酶家族新基因,为进一步研究西瓜半胱氨酸蛋白酶基因ClCP1的表达和功能奠定了基础.
[目的]剋隆西瓜半胱氨痠蛋白酶基因ClCP1,併對其進行生物信息學分析.[方法]以西瓜花蕾cDNA為模闆,藉助西瓜全基因組數據庫,採用RT-PCR方法對西瓜半胱氨痠蛋白酶基因進行剋隆併進行生物信息學分析.[結果]剋隆得到一箇開放閱讀框長度為960bp的序列,命名為ClCP1.該基因編碼319箇氨基痠.ClCP1基因的保守結構域分析結果錶明,ClCP1屬于木瓜蛋白酶傢族基因,與已知其他植物半胱氨痠蛋白酶在氨基痠序列上有56％ ～ 85％的相似性.聚類分析結果顯示,ClCP1與同為葫蘆科的黃瓜CP基因親緣關繫較近.[結論] ClCP1屬于西瓜木瓜蛋白酶傢族新基因,為進一步研究西瓜半胱氨痠蛋白酶基因ClCP1的錶達和功能奠定瞭基礎.
[목적]극륭서과반광안산단백매기인ClCP1,병대기진행생물신식학분석.[방법]이서과화뢰cDNA위모판,차조서과전기인조수거고,채용RT-PCR방법대서과반광안산단백매기인진행극륭병진행생물신식학분석.[결과]극륭득도일개개방열독광장도위960bp적서렬,명명위ClCP1.해기인편마319개안기산.ClCP1기인적보수결구역분석결과표명,ClCP1속우목과단백매가족기인,여이지기타식물반광안산단백매재안기산서렬상유56％ ～ 85％적상사성.취류분석결과현시,ClCP1여동위호호과적황과CP기인친연관계교근.[결론] ClCP1속우서과목과단백매가족신기인,위진일보연구서과반광안산단백매기인ClCP1적표체화공능전정료기출.
