CAJ | 학술논문

目的:通过比较和分析蛇毒中Ⅰ型和Ⅱ型磷脂酶A2(phospholipase A2,PLA2)基因编码的特点,了解蛇毒中两类PLA2分子生物学的信息.方法:从国际基因库中搜寻所有蛇毒PLA2基因信息(mRNA),对于符合研究条件的基因,利用CodonW分析软件和计算机进行分析,计算出两类PLA2的同义密码相对运用值(Relative Synonymous Codon Usage,RSCU),编码区鸟嘌呤/胞嘧啶(GC)含量和GC在三联体密码子中第3位置上所占的百分比(GC3S)含量,以及4种类型的碱基的含量.结果:眼镜蛇科Ⅰ型PLA2和蝰蛇科Ⅱ型PLA2基因编码区GC含量明显不同,蝰蛇科Ⅱ型PLA2的GC含量和GC3S含量分别为53.05％和65.53％,明显高于眼镜蛇科的Ⅰ型PLA2的49.48％和49.68％;RSCU值显示眼镜蛇科Ⅰ型PLA2对29个密码子具有偏好性,蝰蛇科Ⅱ型的有27个密码子,两类PLA2偏好使用的密码有明显不同;蝰蛇科Ⅱ型PLA2的RSCU相对较高;在可以选择密码子的19个氨基酸中,两类PLA2在12个氨基酸有着不同的偏好性;终止密码子具有特殊的偏好性,RSCU值均很高.结论:眼镜蛇科和蝰蛇科的两类PLA2基因在密码子使用上有明显不同的偏好性,蝰蛇科的PLA2偏好程度更强些,这可能与蝰蛇科的PLA2基因位于GC丰富的区域有关.
목적:통과비교화분석사독중Ⅰ형화Ⅱ형린지매A2(phospholipase A2,PLA2)기인편마적특점,료해사독중량류PLA2분자생물학적신식.방법:종국제기인고중수심소유사독PLA2기인신식(mRNA),대우부합연구조건적기인,이용CodonW분석연건화계산궤진행분석,계산출량류PLA2적동의밀마상대운용치(Relative Synonymous Codon Usage,RSCU),편마구조표령/포밀정(GC)함량화GC재삼련체밀마자중제3위치상소점적백분비(GC3S)함량,이급4충류형적감기적함량.결과:안경사과Ⅰ형PLA2화호사과Ⅱ형PLA2기인편마구GC함량명현불동,호사과Ⅱ형PLA2적GC함량화GC3S함량분별위53.05％화65.53％,명현고우안경사과적Ⅰ형PLA2적49.48％화49.68％;RSCU치현시안경사과Ⅰ형PLA2대29개밀마자구유편호성,호사과Ⅱ형적유27개밀마자,량류PLA2편호사용적밀마유명현불동;호사과Ⅱ형PLA2적RSCU상대교고;재가이선택밀마자적19개안기산중,량류PLA2재12개안기산유착불동적편호성;종지밀마자구유특수적편호성,RSCU치균흔고.결론:안경사과화호사과적량류PLA2기인재밀마자사용상유명현불동적편호성,호사과적PLA2편호정도경강사,저가능여호사과적PLA2기인위우GC봉부적구역유관.