军事医学
軍事醫學
군사의학
BULLETIN OF THE ACADEMY OF MILITARY MEDICAL SCIENCES
2013年
12期
922-927
,共6页
李满生%马洁%杨春媛%朱云平
李滿生%馬潔%楊春媛%硃雲平
리만생%마길%양춘원%주운평
蛋白质相互作用%文献挖掘%蛋白质相互作用注释信息%蛋白质相互作用本体
蛋白質相互作用%文獻挖掘%蛋白質相互作用註釋信息%蛋白質相互作用本體
단백질상호작용%문헌알굴%단백질상호작용주석신식%단백질상호작용본체
protein-protein interaction%literature mining%PPI annotation%PPI ontology
目的 针对目前数据库在提供组织、存储和展示文献来源的蛋白质相互作用知识和数据支撑方面的不足,设计并构建了蛋白质相互作用信息数据库系统(protein-protein interaction information database,dbPPH).方法 根据文献来源的蛋白质相互作用数据的特点,使用MySQL设计包含蛋白质相互作用、文献及本体三方面信息的数据库结构,引入本体工具展示数据,并使用JSP等技术开发实现.结果 数据库系统实现了基于本体的信息组织和展示,提供多种数据查询方式及丰富的文献信息,并具有数据下载功能.目前,dbPPII系统已经应用于组织、存储和展示人及小鼠肝脏相关文献挖掘得到的蛋白质相互作用信息.结论 dbPPII系统具有存储和检索文献来源的蛋白质相互作用信息的多种优势,并有效地利用了蛋白质相互作用本体信息框架组织和展示蛋白质相互作用数据.dbPPII访问主页:http://ppii.hupo.org.cn.
目的 針對目前數據庫在提供組織、存儲和展示文獻來源的蛋白質相互作用知識和數據支撐方麵的不足,設計併構建瞭蛋白質相互作用信息數據庫繫統(protein-protein interaction information database,dbPPH).方法 根據文獻來源的蛋白質相互作用數據的特點,使用MySQL設計包含蛋白質相互作用、文獻及本體三方麵信息的數據庫結構,引入本體工具展示數據,併使用JSP等技術開髮實現.結果 數據庫繫統實現瞭基于本體的信息組織和展示,提供多種數據查詢方式及豐富的文獻信息,併具有數據下載功能.目前,dbPPII繫統已經應用于組織、存儲和展示人及小鼠肝髒相關文獻挖掘得到的蛋白質相互作用信息.結論 dbPPII繫統具有存儲和檢索文獻來源的蛋白質相互作用信息的多種優勢,併有效地利用瞭蛋白質相互作用本體信息框架組織和展示蛋白質相互作用數據.dbPPII訪問主頁:http://ppii.hupo.org.cn.
목적 침대목전수거고재제공조직、존저화전시문헌래원적단백질상호작용지식화수거지탱방면적불족,설계병구건료단백질상호작용신식수거고계통(protein-protein interaction information database,dbPPH).방법 근거문헌래원적단백질상호작용수거적특점,사용MySQL설계포함단백질상호작용、문헌급본체삼방면신식적수거고결구,인입본체공구전시수거,병사용JSP등기술개발실현.결과 수거고계통실현료기우본체적신식조직화전시,제공다충수거사순방식급봉부적문헌신식,병구유수거하재공능.목전,dbPPII계통이경응용우조직、존저화전시인급소서간장상관문헌알굴득도적단백질상호작용신식.결론 dbPPII계통구유존저화검색문헌래원적단백질상호작용신식적다충우세,병유효지이용료단백질상호작용본체신식광가조직화전시단백질상호작용수거.dbPPII방문주혈:http://ppii.hupo.org.cn.