大豆中GmKAB1基因的克隆和信息学分析
대두중GmKAB1기인적극륭화신식학분석
Molecular cloning and bioinformatics analysis of GmKAB1 from soybean[Glycine max (L.) Merri]
  • 万方数据
    中国油料作物学报 중국유료작물학보
    CHINESE JOURNAL OF OIL CROP SCIENCES
    2014年 1期 18-24 ,共7页

    朱晓玲%郝青南%陈海峰%王程%陈李淼%沙爱华%陈水莲%周蓉%周新安

    주효령%학청남%진해봉%왕정%진리묘%사애화%진수련%주용%주신안

    大豆%钾离子通道基因%克隆%实时荧光定量PCR%生物信息学分析%同源性分析%系统发育分析 大豆%鉀離子通道基因%剋隆%實時熒光定量PCR%生物信息學分析%同源性分析%繫統髮育分析
    대두%갑리자통도기인%극륭%실시형광정량PCR%생물신식학분석%동원성분석%계통발육분석
    Soybean [Glycine max (L.) Merri]%Potassium channel%Cloning%Real-time PCR%Bioinformatics analysis%Homologous analysis%Phylogenetic analysis
    为探讨GmKAB1在大豆处于低钾胁迫下的表达水平,以大豆钾高效品系油06-71和钾敏感型品系衡春04-11为试验材料,设置低钾胁迫试验,分别在处理后0.5h、2h、6h、12h、3d、6d、9d和12d取样提取RNA,利用Realtime-PCR检测各时间段GmKAB1基因的表达量.结果显示GmKAB1基因在地下部分表达比地上部持续时间更长,地下部相对表达倍数最高为3.5,较地上部相对表达倍数更高.克隆目的基因并对基因序列进行同源性及生物信息学分析,结果表明,与GmKAB1基因相似性在30％以上的同源基因有45个,GmKAB1在进化树中的位置与Gly-ma20g19000最近;GmKAB1编码蛋白为稳定的可溶性蛋白,具有2个保守结构域,多个磷酸化位点,表明在受到低钾胁迫后该基因编码的β亚基与α亚基结合调控电压门控钾离子通道,对大豆从根部获取钾离子可能起着关键作用.
    위탐토GmKAB1재대두처우저갑협박하적표체수평,이대두갑고효품계유06-71화갑민감형품계형춘04-11위시험재료,설치저갑협박시험,분별재처리후0.5h、2h、6h、12h、3d、6d、9d화12d취양제취RNA,이용Realtime-PCR검측각시간단GmKAB1기인적표체량.결과현시GmKAB1기인재지하부분표체비지상부지속시간경장,지하부상대표체배수최고위3.5,교지상부상대표체배수경고.극륭목적기인병대기인서렬진행동원성급생물신식학분석,결과표명,여GmKAB1기인상사성재30％이상적동원기인유45개,GmKAB1재진화수중적위치여Gly-ma20g19000최근;GmKAB1편마단백위은정적가용성단백,구유2개보수결구역,다개린산화위점,표명재수도저갑협박후해기인편마적β아기여α아기결합조공전압문공갑리자통도,대대두종근부획취갑리자가능기착관건작용.
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