家畜生态学报
傢畜生態學報
가축생태학보
ACTA ECOLOGAE ANIMALIS DOMASTICI
2014年
1期
15-20
,共6页
李雯%罗虹%柴志欣%钟金城
李雯%囉虹%柴誌訢%鐘金城
리문%라홍%시지흔%종금성
牦牛%FSHR%基因克隆%序列分析
牦牛%FSHR%基因剋隆%序列分析
모우%FSHR%기인극륭%서렬분석
yak%FSHR%cloning%sequence analysis
利用PCR和T-A克隆技术,测定了麦洼牦牛和杂种犏牛的FSHR基因5 '端侧翼区和第1外显子的核苷酸序列,并运用BLAST、DNAMAN、Clustal等生物信息学软件与其他物种的相应序列进行了同源性比对分析,为牦牛FSHR基因结构、犏牛雄性不育、牦牛遗传多样性,以及FSHR基因与牦牛的繁殖、产肉、产奶性状相关分析提供了理论基础.结果表明:牦牛和犏牛FSHR基因5 '端侧翼区长度为970 bp,普通牛、羊和猪的该序列长度分别为970、973和981 bp,序列长度差异较小;序列突变以碱基替换为主,牦牛与犏牛、普通牛、羊及猪的核苷酸序列一致性分别为99.4%、99.3%、98.2%、96.9%,一致性较高,为同源基因.聚类分析中牦牛与犏牛首先相聚,再依次与普通牛、羊、猪聚在一起.根据核苷酸序列推测,氨基酸组成分析显示,牦牛和犏牛的该蛋白疏水性,蛋白的亲水性和稳定性较差,为不稳定的脂溶性蛋白;二级结构主要以α螺旋和随机卷曲为主.
利用PCR和T-A剋隆技術,測定瞭麥窪牦牛和雜種犏牛的FSHR基因5 '耑側翼區和第1外顯子的覈苷痠序列,併運用BLAST、DNAMAN、Clustal等生物信息學軟件與其他物種的相應序列進行瞭同源性比對分析,為牦牛FSHR基因結構、犏牛雄性不育、牦牛遺傳多樣性,以及FSHR基因與牦牛的繁殖、產肉、產奶性狀相關分析提供瞭理論基礎.結果錶明:牦牛和犏牛FSHR基因5 '耑側翼區長度為970 bp,普通牛、羊和豬的該序列長度分彆為970、973和981 bp,序列長度差異較小;序列突變以堿基替換為主,牦牛與犏牛、普通牛、羊及豬的覈苷痠序列一緻性分彆為99.4%、99.3%、98.2%、96.9%,一緻性較高,為同源基因.聚類分析中牦牛與犏牛首先相聚,再依次與普通牛、羊、豬聚在一起.根據覈苷痠序列推測,氨基痠組成分析顯示,牦牛和犏牛的該蛋白疏水性,蛋白的親水性和穩定性較差,為不穩定的脂溶性蛋白;二級結構主要以α螺鏇和隨機捲麯為主.
이용PCR화T-A극륭기술,측정료맥와모우화잡충편우적FSHR기인5 '단측익구화제1외현자적핵감산서렬,병운용BLAST、DNAMAN、Clustal등생물신식학연건여기타물충적상응서렬진행료동원성비대분석,위모우FSHR기인결구、편우웅성불육、모우유전다양성,이급FSHR기인여모우적번식、산육、산내성상상관분석제공료이론기출.결과표명:모우화편우FSHR기인5 '단측익구장도위970 bp,보통우、양화저적해서렬장도분별위970、973화981 bp,서렬장도차이교소;서렬돌변이감기체환위주,모우여편우、보통우、양급저적핵감산서렬일치성분별위99.4%、99.3%、98.2%、96.9%,일치성교고,위동원기인.취류분석중모우여편우수선상취,재의차여보통우、양、저취재일기.근거핵감산서렬추측,안기산조성분석현시,모우화편우적해단백소수성,단백적친수성화은정성교차,위불은정적지용성단백;이급결구주요이α라선화수궤권곡위주.