家畜生态学报
傢畜生態學報
가축생태학보
ACTA ECOLOGAE ANIMALIS DOMASTICI
2014年
1期
9-14,20
,共7页
马建青%李祥龙%周荣艳%李兰会%杨清芳
馬建青%李祥龍%週榮豔%李蘭會%楊清芳
마건청%리상룡%주영염%리란회%양청방
Agouti%ASIP%AgRP%生物信息学
Agouti%ASIP%AgRP%生物信息學
Agouti%ASIP%AgRP%생물신식학
Agouti%ASIP%AgRP%bioinformatics
利用生物信息学的方法研究人、绵羊和牛等18个物种Agouti信号蛋白(ASIP)和Agouti相关蛋白(AgRP)的编码区及其对应氨基酸序列的相关特征,以期探明两种蛋白的遗传分化特点.结果表明,在ASIP与AgRP均为399bp的CDS序列中,其核苷酸保守区域的位置分别在262~399 bp和230~399 bp处;ASIP和AgRP在各自CDS序列多态位点变异的各项指标数值及其百分率大小上均极为接近;在46条ASIP的CDS序列及32条AgRP的CDS序列中,二者的单倍型数分别为22种和23种,ASIP和AgRP在基因的进化以及不同物种的遗传分化上具有相似性;两者的氨基酸序列在98~140 aa片段处保守性较高,该区域同时富含半胱氨酸(Cys);ASIP和AgRP一级结构的理化性质表现为共性与差异并存;二者的肽链C端具有相似的三维结构,但各自也具有其结构特异性.
利用生物信息學的方法研究人、綿羊和牛等18箇物種Agouti信號蛋白(ASIP)和Agouti相關蛋白(AgRP)的編碼區及其對應氨基痠序列的相關特徵,以期探明兩種蛋白的遺傳分化特點.結果錶明,在ASIP與AgRP均為399bp的CDS序列中,其覈苷痠保守區域的位置分彆在262~399 bp和230~399 bp處;ASIP和AgRP在各自CDS序列多態位點變異的各項指標數值及其百分率大小上均極為接近;在46條ASIP的CDS序列及32條AgRP的CDS序列中,二者的單倍型數分彆為22種和23種,ASIP和AgRP在基因的進化以及不同物種的遺傳分化上具有相似性;兩者的氨基痠序列在98~140 aa片段處保守性較高,該區域同時富含半胱氨痠(Cys);ASIP和AgRP一級結構的理化性質錶現為共性與差異併存;二者的肽鏈C耑具有相似的三維結構,但各自也具有其結構特異性.
이용생물신식학적방법연구인、면양화우등18개물충Agouti신호단백(ASIP)화Agouti상관단백(AgRP)적편마구급기대응안기산서렬적상관특정,이기탐명량충단백적유전분화특점.결과표명,재ASIP여AgRP균위399bp적CDS서렬중,기핵감산보수구역적위치분별재262~399 bp화230~399 bp처;ASIP화AgRP재각자CDS서렬다태위점변이적각항지표수치급기백분솔대소상균겁위접근;재46조ASIP적CDS서렬급32조AgRP적CDS서렬중,이자적단배형수분별위22충화23충,ASIP화AgRP재기인적진화이급불동물충적유전분화상구유상사성;량자적안기산서렬재98~140 aa편단처보수성교고,해구역동시부함반광안산(Cys);ASIP화AgRP일급결구적이화성질표현위공성여차이병존;이자적태련C단구유상사적삼유결구,단각자야구유기결구특이성.