中国预防兽医学报
中國預防獸醫學報
중국예방수의학보
CHINESE JOURNAL OF PREVENTIVE VETERINARY MEDICINE
2014年
2期
150-153
,共4页
覃绍敏%吴健敏%马琳%袁龙%陈凤莲%马玲%白安斌
覃紹敏%吳健敏%馬琳%袁龍%陳鳳蓮%馬玲%白安斌
담소민%오건민%마림%원룡%진봉련%마령%백안빈
猪博卡病毒%遗传进化分析%基因分型
豬博卡病毒%遺傳進化分析%基因分型
저박잡병독%유전진화분석%기인분형
porcine Bocavirus%phylogenetic analysis%genotyping
为了解猪博卡病毒(PBoV)的基因组结构和遗传进化规律,并研究可行的PBoV基因分型方法,本研究利用GenBank中登录的28条PBoV全基因组序列信息,采用DNAStar生物信息学软件进行基因组序列分析.结果显示,分别选取全基因组、NS1基因、NP1基因和VP1基因构建的系统进化树,其基因分型结果基本一致,PBoV均被划分为3个基因群,基因群内各病毒株的核苷酸序列同源性较高,并且具有独特的序列特征和规律,而各基因群之间病毒株的核苷酸序列同源性非常低,基因组结构差异较大,充分证明了PBoV基因分型的可行性.
為瞭解豬博卡病毒(PBoV)的基因組結構和遺傳進化規律,併研究可行的PBoV基因分型方法,本研究利用GenBank中登錄的28條PBoV全基因組序列信息,採用DNAStar生物信息學軟件進行基因組序列分析.結果顯示,分彆選取全基因組、NS1基因、NP1基因和VP1基因構建的繫統進化樹,其基因分型結果基本一緻,PBoV均被劃分為3箇基因群,基因群內各病毒株的覈苷痠序列同源性較高,併且具有獨特的序列特徵和規律,而各基因群之間病毒株的覈苷痠序列同源性非常低,基因組結構差異較大,充分證明瞭PBoV基因分型的可行性.
위료해저박잡병독(PBoV)적기인조결구화유전진화규률,병연구가행적PBoV기인분형방법,본연구이용GenBank중등록적28조PBoV전기인조서렬신식,채용DNAStar생물신식학연건진행기인조서렬분석.결과현시,분별선취전기인조、NS1기인、NP1기인화VP1기인구건적계통진화수,기기인분형결과기본일치,PBoV균피화분위3개기인군,기인군내각병독주적핵감산서렬동원성교고,병차구유독특적서렬특정화규률,이각기인군지간병독주적핵감산서렬동원성비상저,기인조결구차이교대,충분증명료PBoV기인분형적가행성.
