生物学杂志
生物學雜誌
생물학잡지
JOURNAL OF BIOLOGY
2014年
1期
1-4,14
,共5页
侯士昌%崔玉琳%温少红%唐志红%秦松
侯士昌%崔玉琳%溫少紅%唐誌紅%秦鬆
후사창%최옥림%온소홍%당지홍%진송
亚心型扁藻(Platymonas subcordiformis)%PCR步移%psbA基因%序列分析
亞心型扁藻(Platymonas subcordiformis)%PCR步移%psbA基因%序列分析
아심형편조(Platymonas subcordiformis)%PCR보이%psbA기인%서렬분석
psbA基因是叶绿体基因组中一个重要的光调控基因,编码光和系统Ⅱ反应中心的D1蛋白.根据叶绿体基因组序列高度保守的特性,利用莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)psbA基因的保守序列(基因登录号:HQ667991.1)设计引物,采用PCR步移的方法从亚心型扁藻(Platymonas subcordiformis)基因组DNA中克隆到psbA基因全长(基因登录号:KF528742).序列分析表明,亚心型扁藻psbA基因全长1939 bp,编码区长度为1062 bp,推导编码353个氨基酸,包括4个赖氨酸残基.有效密码子数显示psbA基因具有明显的密码子偏好性,并且偏好使用以A/T结尾的密码子.相对同义密码子使用度表明25个密码子在编码使用时具有偏好性,其中20个密码子以A/T碱基结尾,占到80%.其终止密码子使用了TAG.
psbA基因是葉綠體基因組中一箇重要的光調控基因,編碼光和繫統Ⅱ反應中心的D1蛋白.根據葉綠體基因組序列高度保守的特性,利用萊茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)psbA基因的保守序列(基因登錄號:HQ667991.1)設計引物,採用PCR步移的方法從亞心型扁藻(Platymonas subcordiformis)基因組DNA中剋隆到psbA基因全長(基因登錄號:KF528742).序列分析錶明,亞心型扁藻psbA基因全長1939 bp,編碼區長度為1062 bp,推導編碼353箇氨基痠,包括4箇賴氨痠殘基.有效密碼子數顯示psbA基因具有明顯的密碼子偏好性,併且偏好使用以A/T結尾的密碼子.相對同義密碼子使用度錶明25箇密碼子在編碼使用時具有偏好性,其中20箇密碼子以A/T堿基結尾,佔到80%.其終止密碼子使用瞭TAG.
psbA기인시협록체기인조중일개중요적광조공기인,편마광화계통Ⅱ반응중심적D1단백.근거협록체기인조서렬고도보수적특성,이용래인의조(Chlamydomonas reinhardtii)psbA기인적보수서렬(기인등록호:HQ667991.1)설계인물,채용PCR보이적방법종아심형편조(Platymonas subcordiformis)기인조DNA중극륭도psbA기인전장(기인등록호:KF528742).서렬분석표명,아심형편조psbA기인전장1939 bp,편마구장도위1062 bp,추도편마353개안기산,포괄4개뢰안산잔기.유효밀마자수현시psbA기인구유명현적밀마자편호성,병차편호사용이A/T결미적밀마자.상대동의밀마자사용도표명25개밀마자재편마사용시구유편호성,기중20개밀마자이A/T감기결미,점도80%.기종지밀마자사용료TAG.
