遵义医学院学报
遵義醫學院學報
준의의학원학보
ACTA ACADEMIAE MEDICINAE ZUNYI
2014年
1期
57-61
,共5页
李岱容%穆柳青%张春燕%杨春
李岱容%穆柳青%張春燕%楊春
리대용%목류청%장춘연%양춘
结核分枝杆菌%ClpC2%序列分析%功能预测
結覈分枝桿菌%ClpC2%序列分析%功能預測
결핵분지간균%ClpC2%서렬분석%공능예측
目的 对结核分枝杆菌的基因clpC2(Rv2667)的同源基因进行序列分析和相似性比较,并对其编码蛋白进行理化性质及功能的预测,为ClpC2蛋白的结构与功能研究提供基础技术资料.方法 根据GeneBank中分枝杆菌clpC2同源基因的核苷酸序列,进行多重序列比对和进化树构建;应用ExPA Sy在线序列分析工具,对结核分枝杆菌ClpC2蛋白质理化性质及保守结构域进行预测;应用Gene ontology (GO)在线软件对ClpC2蛋白酶的功能进行分析.结果 clpC2系统进化树分析,与16 s rRNA基因相比,进化距离明显变大,而在结核分枝杆菌复合群中高度保守.ClpC2蛋白为亲水性非跨膜蛋白,在细胞质表达,具有水解和催化功能,是一个依赖于ATP的Clp亚单位.结论 clpC2基因在结核分枝杆菌复合群中高度保守,其编码的蛋白ClpC2是一个依赖于ATP的水解蛋白酶.
目的 對結覈分枝桿菌的基因clpC2(Rv2667)的同源基因進行序列分析和相似性比較,併對其編碼蛋白進行理化性質及功能的預測,為ClpC2蛋白的結構與功能研究提供基礎技術資料.方法 根據GeneBank中分枝桿菌clpC2同源基因的覈苷痠序列,進行多重序列比對和進化樹構建;應用ExPA Sy在線序列分析工具,對結覈分枝桿菌ClpC2蛋白質理化性質及保守結構域進行預測;應用Gene ontology (GO)在線軟件對ClpC2蛋白酶的功能進行分析.結果 clpC2繫統進化樹分析,與16 s rRNA基因相比,進化距離明顯變大,而在結覈分枝桿菌複閤群中高度保守.ClpC2蛋白為親水性非跨膜蛋白,在細胞質錶達,具有水解和催化功能,是一箇依賴于ATP的Clp亞單位.結論 clpC2基因在結覈分枝桿菌複閤群中高度保守,其編碼的蛋白ClpC2是一箇依賴于ATP的水解蛋白酶.
목적 대결핵분지간균적기인clpC2(Rv2667)적동원기인진행서렬분석화상사성비교,병대기편마단백진행이화성질급공능적예측,위ClpC2단백적결구여공능연구제공기출기술자료.방법 근거GeneBank중분지간균clpC2동원기인적핵감산서렬,진행다중서렬비대화진화수구건;응용ExPA Sy재선서렬분석공구,대결핵분지간균ClpC2단백질이화성질급보수결구역진행예측;응용Gene ontology (GO)재선연건대ClpC2단백매적공능진행분석.결과 clpC2계통진화수분석,여16 s rRNA기인상비,진화거리명현변대,이재결핵분지간균복합군중고도보수.ClpC2단백위친수성비과막단백,재세포질표체,구유수해화최화공능,시일개의뢰우ATP적Clp아단위.결론 clpC2기인재결핵분지간균복합군중고도보수,기편마적단백ClpC2시일개의뢰우ATP적수해단백매.
