海洋通报
海洋通報
해양통보
MARINE SCIENCE BULLETIN
2014年
2期
174-179
,共6页
紫贻贝%核受体(核激素受体)%多序列比对%贝叶斯推断法
紫貽貝%覈受體(覈激素受體)%多序列比對%貝葉斯推斷法
자이패%핵수체(핵격소수체)%다서렬비대%패협사추단법
Mytilus galloprovincialis%nuclear receptor%mutiple alignment%Bayesian phylogenetic analysis
通过对紫贻贝（Mytilus galloprovincialis）公共数据库表达序列的整合分析，共获得29条核受体序列。通过DNA结合结构域（DBD）和配体结合结构域（LBD）的多序列比对，并采用贝叶斯推断法进行系统进化分析，推测其中19个核受体属于NR1亚家族，5个属于NR2亚家族，2个属于NR3亚家族，1个属于NR5亚家族。结果表明紫贻贝中存在HR96、E75、ROR、HNF4、RXR、TLL、SVP、ESR、ERR同源的核受体，并且具有新型的2DBD核受体。
通過對紫貽貝（Mytilus galloprovincialis）公共數據庫錶達序列的整閤分析，共穫得29條覈受體序列。通過DNA結閤結構域（DBD）和配體結閤結構域（LBD）的多序列比對，併採用貝葉斯推斷法進行繫統進化分析，推測其中19箇覈受體屬于NR1亞傢族，5箇屬于NR2亞傢族，2箇屬于NR3亞傢族，1箇屬于NR5亞傢族。結果錶明紫貽貝中存在HR96、E75、ROR、HNF4、RXR、TLL、SVP、ESR、ERR同源的覈受體，併且具有新型的2DBD覈受體。
통과대자이패（Mytilus galloprovincialis）공공수거고표체서렬적정합분석，공획득29조핵수체서렬。통과DNA결합결구역（DBD）화배체결합결구역（LBD）적다서렬비대，병채용패협사추단법진행계통진화분석，추측기중19개핵수체속우NR1아가족，5개속우NR2아가족，2개속우NR3아가족，1개속우NR5아가족。결과표명자이패중존재HR96、E75、ROR、HNF4、RXR、TLL、SVP、ESR、ERR동원적핵수체，병차구유신형적2DBD핵수체。
Sciences, Qingdao 266071, China;3. North China Sea Marine Engineering Prospecting Research Institute, SOA, Qingdao 266033, China)Based on Mytilus galloprovincialis transcriptome data from public archives, we obtained 29 contigs encoding nuclear receptors. Mutiple alignment and Bayesian phylogenetic analysis indicate that 19 contigs encode NR1 subfamily members, 5 contigs encode NR2 subfamily members, 2 contigs encode NR3 subfamily members and 1 contig encodes a NR5 subfamily member. It suggests that M. galloprovincialis possesses genes homologous to HR96、 E75、 ROR、 HNF4、 RXR、TLL、 SVP、 ESR、 ERR and a new type 2DBD-NR.
