西南农业学报
西南農業學報
서남농업학보
SOUTHWEST CHINA JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
1期
53-58
,共6页
曾绍华%张聪%李明%屈会娟%张敏%阎文昭%蒲志刚
曾紹華%張聰%李明%屈會娟%張敏%閻文昭%蒲誌剛
증소화%장총%리명%굴회연%장민%염문소%포지강
紫薯%黑斑病菌诱导%抑制差减杂交技术%表达序列标签
紫藷%黑斑病菌誘導%抑製差減雜交技術%錶達序列標籤
자서%흑반병균유도%억제차감잡교기술%표체서렬표첨
Purple sweet potato%Black rot induction%SSH%ESTs
本研究以紫薯1号为材料,运用抑制性差减杂交(SSH)技术,构建了经罴斑病菌诱导12、24、36、48、60h后的甘薯块根混合SSH cDNA文库.随机挑取103个cDNA克隆进行5端测序,共获得87个非重复序列,其中包括29个重叠群,58个独立的ES-Ts,利用tblastx对87个序列在NCBI数据库中进行同源性比对.结果表明,在编号为14的EST中找到了“蔷薇”黑斑抗性muRdr1基因位点,基因全序列包括muRdr1A、muRdr1B、muRdr1C、muRdr1D、muRdr1E、muRdr 1F、muRdr1G、muRdr1H、muRdr1共9个基因.另外有2类基因的含量较高,一类是紫薯组织特异性相关基因,另一类是紫薯受干旱胁迫的抗逆相关基因.构建cDNA文库,应用EST技术并结合生物信息学技术,对紫薯抗病相关基因的表达分析,从基因水平上来研究紫薯抗病机制,为今后的紫薯抗病遗传育种及抗病机理奠定论基础.
本研究以紫藷1號為材料,運用抑製性差減雜交(SSH)技術,構建瞭經羆斑病菌誘導12、24、36、48、60h後的甘藷塊根混閤SSH cDNA文庫.隨機挑取103箇cDNA剋隆進行5耑測序,共穫得87箇非重複序列,其中包括29箇重疊群,58箇獨立的ES-Ts,利用tblastx對87箇序列在NCBI數據庫中進行同源性比對.結果錶明,在編號為14的EST中找到瞭“薔薇”黑斑抗性muRdr1基因位點,基因全序列包括muRdr1A、muRdr1B、muRdr1C、muRdr1D、muRdr1E、muRdr 1F、muRdr1G、muRdr1H、muRdr1共9箇基因.另外有2類基因的含量較高,一類是紫藷組織特異性相關基因,另一類是紫藷受榦旱脅迫的抗逆相關基因.構建cDNA文庫,應用EST技術併結閤生物信息學技術,對紫藷抗病相關基因的錶達分析,從基因水平上來研究紫藷抗病機製,為今後的紫藷抗病遺傳育種及抗病機理奠定論基礎.
본연구이자서1호위재료,운용억제성차감잡교(SSH)기술,구건료경비반병균유도12、24、36、48、60h후적감서괴근혼합SSH cDNA문고.수궤도취103개cDNA극륭진행5단측서,공획득87개비중복서렬,기중포괄29개중첩군,58개독립적ES-Ts,이용tblastx대87개서렬재NCBI수거고중진행동원성비대.결과표명,재편호위14적EST중조도료“장미”흑반항성muRdr1기인위점,기인전서렬포괄muRdr1A、muRdr1B、muRdr1C、muRdr1D、muRdr1E、muRdr 1F、muRdr1G、muRdr1H、muRdr1공9개기인.령외유2류기인적함량교고,일류시자서조직특이성상관기인,령일류시자서수간한협박적항역상관기인.구건cDNA문고,응용EST기술병결합생물신식학기술,대자서항병상관기인적표체분석,종기인수평상래연구자서항병궤제,위금후적자서항병유전육충급항병궤리전정론기출.
