华北农学报
華北農學報
화북농학보
ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA
2013年
6期
42-52
,共11页
张德双%李振兴%于拴仓%张凤兰%余阳俊%赵岫云%汪维红
張德雙%李振興%于拴倉%張鳳蘭%餘暘俊%趙岫雲%汪維紅
장덕쌍%리진흥%우전창%장봉란%여양준%조수운%왕유홍
大白菜%CMS96细胞质不育%保持系%RNA编辑
大白菜%CMS96細胞質不育%保持繫%RNA編輯
대백채%CMS96세포질불육%보지계%RNA편집
Chinese Cabbage%Male sterile CMS96%Maintainer line%RNA editing
RNA编辑具有重要的生物学意义,可导致基因功能缺陷或丧失,是造成不育的原因之一。以大白菜CMS96不育系和保持系为材料,研究了线粒体atp6和coxⅠ基因的RNA编辑现象。结果表明,在CMS96不育系中,atp6基因转录本保守区域内有14个位点发生了编辑,导致atp6基因的大多数氨基酸由疏水性变为亲水性,使线粒体atp6蛋白质的亲水性增强。不育系atp6基因中的第5位T→A和第11位G→U的编辑导致2个新的终止子密码子TAG和UGA的发生,产生了2个新的ORF;coxⅠ基因转录本保守区域内编辑位点有17个,导致coxⅠ基因的大多数氨基酸由亲水性变为疏水性,使线粒体cox Ⅰ蛋白质的疏水性增强。在CMS96不育系中,线粒体atp6和coxⅠ基因RNA编辑位点大多数发生于密码子的第1和第2位点,改变了氨基酸种类,少数发生于密码子的第3位点,没有改变氨基酸的种类,这与众多学者的结论一致。碱基的编辑方式除了C→U外,还出现了A→G、G→A、T→G、G→U、T→C、T→A和C→A这7种新的编辑方式。大白菜保持系的RNA编辑位点均比CMS96不育系的编辑位点少。
RNA編輯具有重要的生物學意義,可導緻基因功能缺陷或喪失,是造成不育的原因之一。以大白菜CMS96不育繫和保持繫為材料,研究瞭線粒體atp6和coxⅠ基因的RNA編輯現象。結果錶明,在CMS96不育繫中,atp6基因轉錄本保守區域內有14箇位點髮生瞭編輯,導緻atp6基因的大多數氨基痠由疏水性變為親水性,使線粒體atp6蛋白質的親水性增彊。不育繫atp6基因中的第5位T→A和第11位G→U的編輯導緻2箇新的終止子密碼子TAG和UGA的髮生,產生瞭2箇新的ORF;coxⅠ基因轉錄本保守區域內編輯位點有17箇,導緻coxⅠ基因的大多數氨基痠由親水性變為疏水性,使線粒體cox Ⅰ蛋白質的疏水性增彊。在CMS96不育繫中,線粒體atp6和coxⅠ基因RNA編輯位點大多數髮生于密碼子的第1和第2位點,改變瞭氨基痠種類,少數髮生于密碼子的第3位點,沒有改變氨基痠的種類,這與衆多學者的結論一緻。堿基的編輯方式除瞭C→U外,還齣現瞭A→G、G→A、T→G、G→U、T→C、T→A和C→A這7種新的編輯方式。大白菜保持繫的RNA編輯位點均比CMS96不育繫的編輯位點少。
RNA편집구유중요적생물학의의,가도치기인공능결함혹상실,시조성불육적원인지일。이대백채CMS96불육계화보지계위재료,연구료선립체atp6화coxⅠ기인적RNA편집현상。결과표명,재CMS96불육계중,atp6기인전록본보수구역내유14개위점발생료편집,도치atp6기인적대다수안기산유소수성변위친수성,사선립체atp6단백질적친수성증강。불육계atp6기인중적제5위T→A화제11위G→U적편집도치2개신적종지자밀마자TAG화UGA적발생,산생료2개신적ORF;coxⅠ기인전록본보수구역내편집위점유17개,도치coxⅠ기인적대다수안기산유친수성변위소수성,사선립체cox Ⅰ단백질적소수성증강。재CMS96불육계중,선립체atp6화coxⅠ기인RNA편집위점대다수발생우밀마자적제1화제2위점,개변료안기산충류,소수발생우밀마자적제3위점,몰유개변안기산적충류,저여음다학자적결론일치。감기적편집방식제료C→U외,환출현료A→G、G→A、T→G、G→U、T→C、T→A화C→A저7충신적편집방식。대백채보지계적RNA편집위점균비CMS96불육계적편집위점소。
RNA editing is an important biological processing of RNA .It is one of reasons of male sterility for making genes abnormal or non-functional.RNA editing of atp6 and coxⅠgenes in male-sterile line CMS96 and it’ s maintainer line were analyzed .Results showed that 14 editing sites were observed in atp6 gene of CMS96.Of these ,12 editing sites changed characteristics of amino acid and increased protein hydrophilicity .In atp6 gene of CMS96 line,base substitutions of T→A and G→U occurred at the 5th and 11th editing sites created two stop co-dons TAG and UGA that led to new ORFs .17 editing sites were observed in coxⅠgene of CMS96.Of these,10 edi-ting sites changed characteristics of amino acid and increased protein hydrophobicity .Most editing sites of atp6 and coxⅠgenes happened at 1th and 2th positions of codons .Except for C→U ,new types of A→G,G→A,T→G,G→U,T→C,T→A and C→A were found .There were more editing sites in CMS 96 than those of maintainer line .