西北植物学报
西北植物學報
서북식물학보
ACTA BOTANICA BOREALI-OCCIDENTALIA SINICA
2014年
2期
237-242
,共6页
龙眼%体胚发生%未知蛋白DlUP-3%基因克隆%定量表达
龍眼%體胚髮生%未知蛋白DlUP-3%基因剋隆%定量錶達
용안%체배발생%미지단백DlUP-3%기인극륭%정량표체
Dimocarpus longan%somatic embryogenesis%unknown protein DlUP-3%gene clone%quantitative expression
在龙眼体胚发生早期的蛋白质组学研究中,发现1个体胚发生相关未知蛋白DlUP-3,通过简并引物结合RACE技术进行其基因全长序列克隆.结果显示:(1)克隆到的龙眼体胚发生相关未知蛋白基因DlUP-3的全长cDNA序列为1 681 bp,开放阅读框由1 017个核苷酸组成,编码338个氨基酸(GenBank登录号为GQ167202).(2)生物信息学分析发现,该基因推导蛋白分子量为36 854.2 Da,pI为9.05;该蛋白为Ras蛋白质家族成员,具有ATP/GTP-binding site motif A(P loop)结合位点和1个典型的Ras_like_GTPase superfamily组件,无典型信号肽结构,但有跨膜螺旋的亲水性蛋白；不规则卷曲是其最大量的结构元件,散布于整个蛋白质中.(3)实时荧光定量PCR分析显示,该基因在龙眼体胚发生过程中均有表达,其中以胚性愈伤组织阶段表达量最低,而球形胚阶段最高.研究表明,DlUP-3基因在龙眼体胚发生过程尤其是球形胚阶段有重要的作用,为进一步研究该基因在龙眼体胚发生过程中的功能奠定了基础.
在龍眼體胚髮生早期的蛋白質組學研究中,髮現1箇體胚髮生相關未知蛋白DlUP-3,通過簡併引物結閤RACE技術進行其基因全長序列剋隆.結果顯示:(1)剋隆到的龍眼體胚髮生相關未知蛋白基因DlUP-3的全長cDNA序列為1 681 bp,開放閱讀框由1 017箇覈苷痠組成,編碼338箇氨基痠(GenBank登錄號為GQ167202).(2)生物信息學分析髮現,該基因推導蛋白分子量為36 854.2 Da,pI為9.05;該蛋白為Ras蛋白質傢族成員,具有ATP/GTP-binding site motif A(P loop)結閤位點和1箇典型的Ras_like_GTPase superfamily組件,無典型信號肽結構,但有跨膜螺鏇的親水性蛋白；不規則捲麯是其最大量的結構元件,散佈于整箇蛋白質中.(3)實時熒光定量PCR分析顯示,該基因在龍眼體胚髮生過程中均有錶達,其中以胚性愈傷組織階段錶達量最低,而毬形胚階段最高.研究錶明,DlUP-3基因在龍眼體胚髮生過程尤其是毬形胚階段有重要的作用,為進一步研究該基因在龍眼體胚髮生過程中的功能奠定瞭基礎.
재용안체배발생조기적단백질조학연구중,발현1개체배발생상관미지단백DlUP-3,통과간병인물결합RACE기술진행기기인전장서렬극륭.결과현시:(1)극륭도적용안체배발생상관미지단백기인DlUP-3적전장cDNA서렬위1 681 bp,개방열독광유1 017개핵감산조성,편마338개안기산(GenBank등록호위GQ167202).(2)생물신식학분석발현,해기인추도단백분자량위36 854.2 Da,pI위9.05;해단백위Ras단백질가족성원,구유ATP/GTP-binding site motif A(P loop)결합위점화1개전형적Ras_like_GTPase superfamily조건,무전형신호태결구,단유과막라선적친수성단백；불규칙권곡시기최대량적결구원건,산포우정개단백질중.(3)실시형광정량PCR분석현시,해기인재용안체배발생과정중균유표체,기중이배성유상조직계단표체량최저,이구형배계단최고.연구표명,DlUP-3기인재용안체배발생과정우기시구형배계단유중요적작용,위진일보연구해기인재용안체배발생과정중적공능전정료기출.
