安徽农学通报
安徽農學通報
안휘농학통보
AUHUI AGRICULTURAL SCIENCE BULLETIN
2014年
8期
24-27,45
,共5页
向文豪%崔国鹏%王圣洁%龚汉雨%余光辉
嚮文豪%崔國鵬%王聖潔%龔漢雨%餘光輝
향문호%최국붕%왕골길%공한우%여광휘
Diurnal软件%生物钟%基因表达%γ-氨基丁酸%拟南芥
Diurnal軟件%生物鐘%基因錶達%γ-氨基丁痠%擬南芥
Diurnal연건%생물종%기인표체%γ-안기정산%의남개
Diurnal online software%Circadian clock%Gene expression%γ-aminobutyric acid%Arabidopsis
Diurnal是一个基于网络的在线分析工具,利用该工具可以得到几种模式植物基因组范围内的昼夜和生物钟节律基因表达的变化规律。这一在线分析软件是一个可供搜索的数据库,它提供了几个基于网络的界面友好的数据挖掘工具,其结果以一种易于理解的方式呈现。在该研究中首先介绍了这个在线软件的使用方法,然后分析了几个拟南芥生物钟节律基因和开花基因在长日照条件下的表达模型,这些结果可以以图形和数字的方式下载用于后续的特定研究。结合在线数据,该研究表明,γ-氨基丁酸(GABA在1.0mmol/L)可以改变3个生物钟核心节律基因(TOC1,CCA1和LHY)的表达模式,这种模式的改变主要是增加了这些基因表达的幅度。
Diurnal是一箇基于網絡的在線分析工具,利用該工具可以得到幾種模式植物基因組範圍內的晝夜和生物鐘節律基因錶達的變化規律。這一在線分析軟件是一箇可供搜索的數據庫,它提供瞭幾箇基于網絡的界麵友好的數據挖掘工具,其結果以一種易于理解的方式呈現。在該研究中首先介紹瞭這箇在線軟件的使用方法,然後分析瞭幾箇擬南芥生物鐘節律基因和開花基因在長日照條件下的錶達模型,這些結果可以以圖形和數字的方式下載用于後續的特定研究。結閤在線數據,該研究錶明,γ-氨基丁痠(GABA在1.0mmol/L)可以改變3箇生物鐘覈心節律基因(TOC1,CCA1和LHY)的錶達模式,這種模式的改變主要是增加瞭這些基因錶達的幅度。
Diurnal시일개기우망락적재선분석공구,이용해공구가이득도궤충모식식물기인조범위내적주야화생물종절률기인표체적변화규률。저일재선분석연건시일개가공수색적수거고,타제공료궤개기우망락적계면우호적수거알굴공구,기결과이일충역우리해적방식정현。재해연구중수선개소료저개재선연건적사용방법,연후분석료궤개의남개생물종절률기인화개화기인재장일조조건하적표체모형,저사결과가이이도형화수자적방식하재용우후속적특정연구。결합재선수거,해연구표명,γ-안기정산(GABA재1.0mmol/L)가이개변3개생물종핵심절률기인(TOC1,CCA1화LHY)적표체모식,저충모식적개변주요시증가료저사기인표체적폭도。
Diurnal is a web-based tool for accessing the diurnal and circadian genome-wide expression re-sults of genes from several array experiments conducted on common model plants. The database is search-able and provides access to several user-friendly Web-based data-mining tools with easy-to-understand output. Here we first introduced the method of this online software application and analyzed the model pat-tern of some circadian clock gene components in the longday growth condition in Arabidopsis. These re-sults can be accessed both graphically and numerically downloaded for further use in a specific study. Combining with the wet-lab experiment,we showed that application of γ-aminobutyric acid(GABA at 1.0 mmol/L)can change the pattern of the 3 core circadian clock gene(TOC1,CCA1 and LHY),mainly increas-ing the amplitude of the gene expression.