农业生物技术学报
農業生物技術學報
농업생물기술학보
JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY
2014年
2期
257-264
,共8页
刘金泊%欧静%姚富姣%何磊%奚耕思%魏朝明
劉金泊%歐靜%姚富姣%何磊%奚耕思%魏朝明
류금박%구정%요부교%하뢰%해경사%위조명
赤拟谷盗%内参基因%qRT-PCR%geNorm%NormFinder
赤擬穀盜%內參基因%qRT-PCR%geNorm%NormFinder
적의곡도%내삼기인%qRT-PCR%geNorm%NormFinder
Tribolium castaneum%Reference genes%qRT-PCR%GeNorm%NormFinder
实时定量RT-PCR(qRT-PCR)是进行基因表达水平分析的一种常用技术手段,而选择相对稳定的内参基因对数据进行标准化是获得可信数据的关键.本研究使用qRT-PCR技术评价8个内参基因—β-actin、GAPDH、α-Tubulin、SYN1、SYN6、RPS3、RPS18和RPL13a在磷化氢诱导后的不同品系赤拟谷盗(Tribolium castaneum)中的表达水平,采用相对定量方法并分别使用geNorm和NormFinder程序进行数据分析.其中经geNorm软件分析的8个内参基因的稳定性由高到低排列顺序为RPS18 =RPL13a (0.007)>SYN6 (0.015) RPS3 (0.038)β-actin (0.044)α-Tubulin (0.105) SYN1 (0.154)GAPDH (0.205),且内参基因配对差异值V2/3值为0.006,从而确定内参基因的最适数目为2个,分别为RPS18和RPL13a.NormFinder与geNorm相似,其运行结果以稳定值的大小排序,经NormFinder分析的各内参基因的稳定性由高到低的排列顺序为RPS18 (0.002)> RPL13a(0.016)> β-actin(0.042) >RPS3(0.044) SYN6(0.055)>α-Tubulin(0.066)> SYN1(O.077)> GAPDH (0.126),由此得出RPS18的稳定性最高,最终由该程序判定的最佳组合是RPS18和RPL13a.因此,geNorm和NormFinder两款软件的分析结果一致,最终确定相对适合的内参基因有两个:RPS18和RPL13a,该结果为赤拟谷盗基因的表达研究提供了基础资料,也为其他昆虫内参基因的筛选提供参考.
實時定量RT-PCR(qRT-PCR)是進行基因錶達水平分析的一種常用技術手段,而選擇相對穩定的內參基因對數據進行標準化是穫得可信數據的關鍵.本研究使用qRT-PCR技術評價8箇內參基因—β-actin、GAPDH、α-Tubulin、SYN1、SYN6、RPS3、RPS18和RPL13a在燐化氫誘導後的不同品繫赤擬穀盜(Tribolium castaneum)中的錶達水平,採用相對定量方法併分彆使用geNorm和NormFinder程序進行數據分析.其中經geNorm軟件分析的8箇內參基因的穩定性由高到低排列順序為RPS18 =RPL13a (0.007)>SYN6 (0.015) RPS3 (0.038)β-actin (0.044)α-Tubulin (0.105) SYN1 (0.154)GAPDH (0.205),且內參基因配對差異值V2/3值為0.006,從而確定內參基因的最適數目為2箇,分彆為RPS18和RPL13a.NormFinder與geNorm相似,其運行結果以穩定值的大小排序,經NormFinder分析的各內參基因的穩定性由高到低的排列順序為RPS18 (0.002)> RPL13a(0.016)> β-actin(0.042) >RPS3(0.044) SYN6(0.055)>α-Tubulin(0.066)> SYN1(O.077)> GAPDH (0.126),由此得齣RPS18的穩定性最高,最終由該程序判定的最佳組閤是RPS18和RPL13a.因此,geNorm和NormFinder兩款軟件的分析結果一緻,最終確定相對適閤的內參基因有兩箇:RPS18和RPL13a,該結果為赤擬穀盜基因的錶達研究提供瞭基礎資料,也為其他昆蟲內參基因的篩選提供參攷.
실시정량RT-PCR(qRT-PCR)시진행기인표체수평분석적일충상용기술수단,이선택상대은정적내삼기인대수거진행표준화시획득가신수거적관건.본연구사용qRT-PCR기술평개8개내삼기인—β-actin、GAPDH、α-Tubulin、SYN1、SYN6、RPS3、RPS18화RPL13a재린화경유도후적불동품계적의곡도(Tribolium castaneum)중적표체수평,채용상대정량방법병분별사용geNorm화NormFinder정서진행수거분석.기중경geNorm연건분석적8개내삼기인적은정성유고도저배렬순서위RPS18 =RPL13a (0.007)>SYN6 (0.015) RPS3 (0.038)β-actin (0.044)α-Tubulin (0.105) SYN1 (0.154)GAPDH (0.205),차내삼기인배대차이치V2/3치위0.006,종이학정내삼기인적최괄수목위2개,분별위RPS18화RPL13a.NormFinder여geNorm상사,기운행결과이은정치적대소배서,경NormFinder분석적각내삼기인적은정성유고도저적배렬순서위RPS18 (0.002)> RPL13a(0.016)> β-actin(0.042) >RPS3(0.044) SYN6(0.055)>α-Tubulin(0.066)> SYN1(O.077)> GAPDH (0.126),유차득출RPS18적은정성최고,최종유해정서판정적최가조합시RPS18화RPL13a.인차,geNorm화NormFinder량관연건적분석결과일치,최종학정상대괄합적내삼기인유량개:RPS18화RPL13a,해결과위적의곡도기인적표체연구제공료기출자료,야위기타곤충내삼기인적사선제공삼고.