CAJ | 학술논문

高密度脂蛋白结合蛋白(high density lipoprotein binding protein,HBP)在动物的脂肪代谢中发挥重要的作用.脂类是鱼类的重要能源物质,尤其是那些对糖类利用率很低的肉食性鱼类.HBP基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)可能会影响脂肪代谢,而对大口黑鲈的生长性状产生影响,研究其SNP与生长性状的相关性可为其分子标记辅助选择提供候选标记.本研究根据大口黑鲈(Micropterus salmoides) EST-SNP库中HBP基因的序列(GenBank accession No.KF652241),用直接测序法在HBP基因3’非编码区获得了3个SNPs位点:H1(G+2782T),H2(T+2817C)和H3(G+2857A);随机选择同批繁殖、同塘养殖的165尾大口黑鲈样本,对3个SNPs位点用SnaPshot方法进行检测和分型,分型结果用软件Popgene32进行遗传结构分析;运用软件spss17.0的一般线性模型(general linear model,GLM)对获得的不同基因型与生长性状进行关联分析.结果表明,3个位点均处于哈温平衡,其中H1和H2位点组成了两种单倍型(A和B),观测到3种基因型(AA、AB和BB);H1、H2和H3共组成6种双倍型(D1、D2、D3、D4、D5和D6).不同基因型与生长性状的相关性分析显示,基因型BB在体质量和全长形态指标显著高于基因型AB(P＜0.05),双倍型D6在体质量和全长形态指标显著高于双倍型D4(P＜0.05).本研究在大口黑鲈HBP基因3’非编码区获得了与生长性状相关的SNPs标记,可应用于大口黑鲈分子标记辅助选择育种.
고밀도지단백결합단백(high density lipoprotein binding protein,HBP)재동물적지방대사중발휘중요적작용.지류시어류적중요능원물질,우기시나사대당류이용솔흔저적육식성어류.HBP기인적단핵감산다태성(single nucleotide polymorphism,SNP)가능회영향지방대사,이대대구흑로적생장성상산생영향,연구기SNP여생장성상적상관성가위기분자표기보조선택제공후선표기.본연구근거대구흑로(Micropterus salmoides) EST-SNP고중HBP기인적서렬(GenBank accession No.KF652241),용직접측서법재HBP기인3’비편마구획득료3개SNPs위점:H1(G+2782T),H2(T+2817C)화H3(G+2857A);수궤선택동비번식、동당양식적165미대구흑로양본,대3개SNPs위점용SnaPshot방법진행검측화분형,분형결과용연건Popgene32진행유전결구분석;운용연건spss17.0적일반선성모형(general linear model,GLM)대획득적불동기인형여생장성상진행관련분석.결과표명,3개위점균처우합온평형,기중H1화H2위점조성료량충단배형(A화B),관측도3충기인형(AA、AB화BB);H1、H2화H3공조성6충쌍배형(D1、D2、D3、D4、D5화D6).불동기인형여생장성상적상관성분석현시,기인형BB재체질량화전장형태지표현저고우기인형AB(P＜0.05),쌍배형D6재체질량화전장형태지표현저고우쌍배형D4(P＜0.05).본연구재대구흑로HBP기인3’비편마구획득료여생장성상상관적SNPs표기,가응용우대구흑로분자표기보조선택육충.