中国生物医学工程学报
中國生物醫學工程學報
중국생물의학공정학보
CHINESE JOURNAL OF BIOMEDICAL ENGINEERING
2013年
4期
418-425
,共8页
阿尔茨海默症%网络成分分析%转录因子%动态网络结构
阿爾茨海默癥%網絡成分分析%轉錄因子%動態網絡結構
아이자해묵증%망락성분분석%전록인자%동태망락결구
Alzheimer's disease%nonnegative matrix factorization%microarray gene expression data
解析转录因子与靶基因之间相互调节的关系并构建转录调控网络,对研究阿尔茨海默症(AD)的致病机理、早期诊断及制药等具有重要意义.网络成分分析(NCA)是一种能够动态预测转录因子活性并表现其影响关系的方法.本研究利用转录因子对靶基因的调控作用,及基因在AD不同病程中表达的先验知识和生物数据,通过预处理AD基因表达数据,选择出10个转录因子和85个靶基因进行网络成分分析,并利用162条调控关系构建AD基因调控网络,形成和展示了转录因子对靶基因的动态调控关系和作用.通过动态预测转录因子活性及构建网络图,发现转录因子在AD疾病的不同程度的活性有明显变化趋势,其调控的靶基因变化符合AD的病理特征.如靶基因NONO在转录因子ANAPC5的调控下,表达值由3 126上升至4 508,而靶基因YWHAZ表达值由6 000下降到接近于0.该研究为AD致病机理探寻、早期诊断和相应的分子生物学实验,提供了新的思路和依据.
解析轉錄因子與靶基因之間相互調節的關繫併構建轉錄調控網絡,對研究阿爾茨海默癥(AD)的緻病機理、早期診斷及製藥等具有重要意義.網絡成分分析(NCA)是一種能夠動態預測轉錄因子活性併錶現其影響關繫的方法.本研究利用轉錄因子對靶基因的調控作用,及基因在AD不同病程中錶達的先驗知識和生物數據,通過預處理AD基因錶達數據,選擇齣10箇轉錄因子和85箇靶基因進行網絡成分分析,併利用162條調控關繫構建AD基因調控網絡,形成和展示瞭轉錄因子對靶基因的動態調控關繫和作用.通過動態預測轉錄因子活性及構建網絡圖,髮現轉錄因子在AD疾病的不同程度的活性有明顯變化趨勢,其調控的靶基因變化符閤AD的病理特徵.如靶基因NONO在轉錄因子ANAPC5的調控下,錶達值由3 126上升至4 508,而靶基因YWHAZ錶達值由6 000下降到接近于0.該研究為AD緻病機理探尋、早期診斷和相應的分子生物學實驗,提供瞭新的思路和依據.
해석전록인자여파기인지간상호조절적관계병구건전록조공망락,대연구아이자해묵증(AD)적치병궤리、조기진단급제약등구유중요의의.망락성분분석(NCA)시일충능구동태예측전록인자활성병표현기영향관계적방법.본연구이용전록인자대파기인적조공작용,급기인재AD불동병정중표체적선험지식화생물수거,통과예처리AD기인표체수거,선택출10개전록인자화85개파기인진행망락성분분석,병이용162조조공관계구건AD기인조공망락,형성화전시료전록인자대파기인적동태조공관계화작용.통과동태예측전록인자활성급구건망락도,발현전록인자재AD질병적불동정도적활성유명현변화추세,기조공적파기인변화부합AD적병리특정.여파기인NONO재전록인자ANAPC5적조공하,표체치유3 126상승지4 508,이파기인YWHAZ표체치유6 000하강도접근우0.해연구위AD치병궤리탐심、조기진단화상응적분자생물학실험,제공료신적사로화의거.
