植物病理学报
植物病理學報
식물병이학보
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA
2013年
6期
590-595
,共6页
施世明%王彦芬%王国平%王利平%徐文兴%洪霓
施世明%王彥芬%王國平%王利平%徐文興%洪霓
시세명%왕언분%왕국평%왕리평%서문흥%홍예
芋%杆状DNA病毒%PCR%序列分析
芋%桿狀DNA病毒%PCR%序列分析
우%간상DNA병독%PCR%서렬분석
taro%Badnavirus%PCR%sequence analysis
采用已报道杆状DNA病毒属(Badnavirus)的通用检测引物BadnaFP/BadnaRP,从7份芋样品中扩增到Badnavirus病毒的RT/RNase H基因保守区域,获得12个克隆序列,长度为576 bp.序列分析结果显示,来自不同样品的克隆间核苷酸和氨基酸序列相似性分别为78.8％ ～ 99.5％和81.3 ％～99.5％;来自同一样品扩增产物的克隆间在序列上也存在较大差异,核苷酸和氨基酸序列相似性分别为89.6％ ～ 100％和92.7％～100％.在系统进化树中,本研究所获序列与Badnavirus病毒的亲缘关系相对较近,聚在同一簇,表明此病毒为Badnavirus属病毒,但与芋杆状病毒(Taro bacilliform virus,TaBV)序列相似性较低,核苷酸和氨基酸相似性分别为58.0％ ～ 62.2％和58.5％ ～64.1％,推测为杆状DNA病毒属的一个新种.根据所测定序列设计了用于该病毒检测的引物P197/P433,对51份芋样品检测结果表明,该引物可有效检测来源于我国芋的Badnavirus病毒.
採用已報道桿狀DNA病毒屬(Badnavirus)的通用檢測引物BadnaFP/BadnaRP,從7份芋樣品中擴增到Badnavirus病毒的RT/RNase H基因保守區域,穫得12箇剋隆序列,長度為576 bp.序列分析結果顯示,來自不同樣品的剋隆間覈苷痠和氨基痠序列相似性分彆為78.8％ ～ 99.5％和81.3 ％～99.5％;來自同一樣品擴增產物的剋隆間在序列上也存在較大差異,覈苷痠和氨基痠序列相似性分彆為89.6％ ～ 100％和92.7％～100％.在繫統進化樹中,本研究所穫序列與Badnavirus病毒的親緣關繫相對較近,聚在同一簇,錶明此病毒為Badnavirus屬病毒,但與芋桿狀病毒(Taro bacilliform virus,TaBV)序列相似性較低,覈苷痠和氨基痠相似性分彆為58.0％ ～ 62.2％和58.5％ ～64.1％,推測為桿狀DNA病毒屬的一箇新種.根據所測定序列設計瞭用于該病毒檢測的引物P197/P433,對51份芋樣品檢測結果錶明,該引物可有效檢測來源于我國芋的Badnavirus病毒.
채용이보도간상DNA병독속(Badnavirus)적통용검측인물BadnaFP/BadnaRP,종7빈우양품중확증도Badnavirus병독적RT/RNase H기인보수구역,획득12개극륭서렬,장도위576 bp.서렬분석결과현시,래자불동양품적극륭간핵감산화안기산서렬상사성분별위78.8％ ～ 99.5％화81.3 ％～99.5％;래자동일양품확증산물적극륭간재서렬상야존재교대차이,핵감산화안기산서렬상사성분별위89.6％ ～ 100％화92.7％～100％.재계통진화수중,본연구소획서렬여Badnavirus병독적친연관계상대교근,취재동일족,표명차병독위Badnavirus속병독,단여우간상병독(Taro bacilliform virus,TaBV)서렬상사성교저,핵감산화안기산상사성분별위58.0％ ～ 62.2％화58.5％ ～64.1％,추측위간상DNA병독속적일개신충.근거소측정서렬설계료용우해병독검측적인물P197/P433,대51빈우양품검측결과표명,해인물가유효검측래원우아국우적Badnavirus병독.
