植物病理学报
植物病理學報
식물병이학보
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA
2013年
6期
581-589
,共9页
冯雯杰%常清乐%杨龙%丁新华%储昭辉
馮雯傑%常清樂%楊龍%丁新華%儲昭輝
풍문걸%상청악%양룡%정신화%저소휘
水稻白叶枯病菌%水稻细菌性条斑病菌%分子标记%植物检疫
水稻白葉枯病菌%水稻細菌性條斑病菌%分子標記%植物檢疫
수도백협고병균%수도세균성조반병균%분자표기%식물검역
Xanthomonas oryzae pv. oryzae%Xanthomonas oryzae pv. oryzicola%molecular markers%plant quarantine
水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae)和细菌性条斑病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzicola)是水稻种子产地检疫中最重要的两种检疫对象,且同属于水稻黄单胞杆菌.本研究基于生物信息学技术构建比较基因组学算法对两种病原的全基因组序列比对分析,得到一系列能够区分两种病原的特异性PCR引物.结合简单的PCR技术及全自动DNA分析系统,我们选取了12对引物分别对23株水稻白叶枯病菌和5株水稻细菌性条斑病菌及其它相关菌株进行验证.结果获得了2对显性标记(Xoo-Hpa1和Xoc-ORF2)以及3对共显性分子标记(M568、M897和M1575)可以达到理想的区分检测两种病原的效果.分子标记的检测灵敏度从5×104到5×107cfu·mL-1不等,且从水稻种子浸提液中也能成功地检测水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌.本研究丰富了检测标记的靶位点,并有效的结合了高通量检测的手段对多位点联合分析,增强了检测的可靠性,有望在今后的植物检疫及病原鉴定中发挥着重要的作用.
水稻白葉枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae)和細菌性條斑病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzicola)是水稻種子產地檢疫中最重要的兩種檢疫對象,且同屬于水稻黃單胞桿菌.本研究基于生物信息學技術構建比較基因組學算法對兩種病原的全基因組序列比對分析,得到一繫列能夠區分兩種病原的特異性PCR引物.結閤簡單的PCR技術及全自動DNA分析繫統,我們選取瞭12對引物分彆對23株水稻白葉枯病菌和5株水稻細菌性條斑病菌及其它相關菌株進行驗證.結果穫得瞭2對顯性標記(Xoo-Hpa1和Xoc-ORF2)以及3對共顯性分子標記(M568、M897和M1575)可以達到理想的區分檢測兩種病原的效果.分子標記的檢測靈敏度從5×104到5×107cfu·mL-1不等,且從水稻種子浸提液中也能成功地檢測水稻白葉枯病菌和細菌性條斑病菌.本研究豐富瞭檢測標記的靶位點,併有效的結閤瞭高通量檢測的手段對多位點聯閤分析,增彊瞭檢測的可靠性,有望在今後的植物檢疫及病原鑒定中髮揮著重要的作用.
수도백협고병균(Xanthomonas oryzae pv.oryzae)화세균성조반병균(Xanthomonas oryzae pv.oryzicola)시수도충자산지검역중최중요적량충검역대상,차동속우수도황단포간균.본연구기우생물신식학기술구건비교기인조학산법대량충병원적전기인조서렬비대분석,득도일계렬능구구분량충병원적특이성PCR인물.결합간단적PCR기술급전자동DNA분석계통,아문선취료12대인물분별대23주수도백협고병균화5주수도세균성조반병균급기타상관균주진행험증.결과획득료2대현성표기(Xoo-Hpa1화Xoc-ORF2)이급3대공현성분자표기(M568、M897화M1575)가이체도이상적구분검측량충병원적효과.분자표기적검측령민도종5×104도5×107cfu·mL-1불등,차종수도충자침제액중야능성공지검측수도백협고병균화세균성조반병균.본연구봉부료검측표기적파위점,병유효적결합료고통량검측적수단대다위점연합분석,증강료검측적가고성,유망재금후적식물검역급병원감정중발휘착중요적작용.
