CAJ | 학술논문

为了对已知的鸡形目禽类黑素皮质素受体1 (MC1R)基因进行生物信息学和分子进化分析,根据已发表的12种鸡形目物种MC1R基因序列(包括棕色来航鸡、红色原鸡、土佐本地鸡、日系乌骨鸡、白色来航鸡、日本鹌鹑、火鸡、蓝胸鹑、珠鸡、朝鲜鹌鹑、河北柴鸡和略阳乌鸡),利用多种生物学软件进行遗传多态性研究.结果显示:12种鸡形目物种MC1R基因编码区碱基序列同源性和氨基酸序列同源性均较高(分别为98.84％,98.91％),蛋白质二级结构相似度极高,以α构螺旋为主(57.32％～67.83％),无规则卷曲次之(25.80％～ 29.62％),β-折叠最少(6.05％～15.61％).红色原鸡、土佐本地鸡和棕色来航鸡的二级结构组成相同,其中红色原鸡和土佐本地鸡的碱基CDS序列完全相同.分子进化分析发现,12个鸡形目物种可以明显地分为A、B、C3个类群,火鸡、珠鸡、鹌鹑、蓝胸鹑、棕色来航鸡、红色原鸡和土佐本地鸡聚为A群;河北柴鸡、朝鲜鹌鹑和日系乌骨鸡聚为B群;白色来航鸡和略阳乌鸡聚为C群.火鸡较其他鸡形目起源较早,棕色来航鸡,白色来航鸡和略阳乌鸡起源较迟.但聚类结果中白色来航鸡和棕色来航鸡却属于不同类群,这可能是由于MC1R基因参与家禽羽色的调控,而白色来航鸡和棕色来航鸡羽毛色素存在明显差异,从而造成了二者在鸡形目MC1R基因分子进化树中的遗传距离较远.
위료대이지적계형목금류흑소피질소수체1 (MC1R)기인진행생물신식학화분자진화분석,근거이발표적12충계형목물충MC1R기인서렬(포괄종색래항계、홍색원계、토좌본지계、일계오골계、백색래항계、일본암순、화계、람흉순、주계、조선암순、하북시계화략양오계),이용다충생물학연건진행유전다태성연구.결과현시:12충계형목물충MC1R기인편마구감기서렬동원성화안기산서렬동원성균교고(분별위98.84％,98.91％),단백질이급결구상사도겁고,이α구라선위주(57.32％～67.83％),무규칙권곡차지(25.80％～ 29.62％),β-절첩최소(6.05％～15.61％).홍색원계、토좌본지계화종색래항계적이급결구조성상동,기중홍색원계화토좌본지계적감기CDS서렬완전상동.분자진화분석발현,12개계형목물충가이명현지분위A、B、C3개류군,화계、주계、암순、람흉순、종색래항계、홍색원계화토좌본지계취위A군;하북시계、조선암순화일계오골계취위B군;백색래항계화략양오계취위C군.화계교기타계형목기원교조,종색래항계,백색래항계화략양오계기원교지.단취류결과중백색래항계화종색래항계각속우불동류군,저가능시유우MC1R기인삼여가금우색적조공,이백색래항계화종색래항계우모색소존재명현차이,종이조성료이자재계형목MC1R기인분자진화수중적유전거리교원.