激光生物学报
激光生物學報
격광생물학보
ACTA LASER BIOLOGY SINICA
2014年
2期
147-154
,共8页
肖文君%胡帅%曾荣%常洪平%袁聪颖%王萍%张骋%陆秀涛%郭新红
肖文君%鬍帥%曾榮%常洪平%袁聰穎%王萍%張騁%陸秀濤%郭新紅
초문군%호수%증영%상홍평%원총영%왕평%장빙%륙수도%곽신홍
拟南芥%高丝氨酸激酶%分子结构%同源建模
擬南芥%高絲氨痠激酶%分子結構%同源建模
의남개%고사안산격매%분자결구%동원건모
Arabidopsis thaliana%homoserine kinase%molecular structure%homology modeling
高丝氨酸激酶(EC 2.7.1.39)是拟南芥中合成甲硫氨酸和苏氨酸的关键酶之一.作者利用DNAMAN软件分析高丝氨酸激酶的氨基酸组成和等电点;利用生物信息学在线网站预测分析其疏水性、二级结构、跨膜结构域、信号肽区域、PEST序列、化学修饰位点及亚细胞定位等;利用SWISS-MODEL软件进行同源建模,使用Chimera(V1.8.1)做结构修饰处理,最后利用Molprobity4及ERRAT(V2.0)对建模结果进行结构质量分析.结果发现:HSK预测等电点为8.48,平均亲水性0.267;二级结构中α-螺旋占34.32％,不规则卷曲占48.11％,延伸链占17.57％;高丝氨酸激酶的预测模型经验证具有稳定的空间结构,符合立体化学规则.
高絲氨痠激酶(EC 2.7.1.39)是擬南芥中閤成甲硫氨痠和囌氨痠的關鍵酶之一.作者利用DNAMAN軟件分析高絲氨痠激酶的氨基痠組成和等電點;利用生物信息學在線網站預測分析其疏水性、二級結構、跨膜結構域、信號肽區域、PEST序列、化學脩飾位點及亞細胞定位等;利用SWISS-MODEL軟件進行同源建模,使用Chimera(V1.8.1)做結構脩飾處理,最後利用Molprobity4及ERRAT(V2.0)對建模結果進行結構質量分析.結果髮現:HSK預測等電點為8.48,平均親水性0.267;二級結構中α-螺鏇佔34.32％,不規則捲麯佔48.11％,延伸鏈佔17.57％;高絲氨痠激酶的預測模型經驗證具有穩定的空間結構,符閤立體化學規則.
고사안산격매(EC 2.7.1.39)시의남개중합성갑류안산화소안산적관건매지일.작자이용DNAMAN연건분석고사안산격매적안기산조성화등전점;이용생물신식학재선망참예측분석기소수성、이급결구、과막결구역、신호태구역、PEST서렬、화학수식위점급아세포정위등;이용SWISS-MODEL연건진행동원건모,사용Chimera(V1.8.1)주결구수식처리,최후이용Molprobity4급ERRAT(V2.0)대건모결과진행결구질량분석.결과발현:HSK예측등전점위8.48,평균친수성0.267;이급결구중α-라선점34.32％,불규칙권곡점48.11％,연신련점17.57％;고사안산격매적예측모형경험증구유은정적공간결구,부합입체화학규칙.
