基础医学与临床
基礎醫學與臨床
기출의학여림상
BASIC MEDICAL SCIENCES AND CLINICS
2014年
7期
939-944
,共6页
薛雯%曹翠辉%眭维国%车文体%陈洁晶%郭丽%戴勇
薛雯%曹翠輝%眭維國%車文體%陳潔晶%郭麗%戴勇
설문%조취휘%휴유국%차문체%진길정%곽려%대용
H3K9me3%ChIP-seq%表观遗传学
H3K9me3%ChIP-seq%錶觀遺傳學
H3K9me3%ChIP-seq%표관유전학
H3K9me3%ChIP-seq%epigenetic
目的 分析人体器官心脏和脾脏的H3K9me3的全基因图谱,以期发现H3K9三甲基化的修饰与组织特异性的表达、功能和发育具有相关性.方法 通过染色质免疫共沉淀的方法获取各标本DNA,通过qPCR验证ChIP结果,然后构建ChIP Sequencing文库,与目的基因组序列比对,获取比对Reads,接着进行全基因组的Peak分析,GO功能富集分析peak相关基因的生物学功能.结果 心脏和脾脏间有169个基因有显著地H3 K9me3差异,其中心脏中H3 K9me3的基因中有64个特殊基因,脾脏中H3 K9 me3的基因中有87个特殊基因.从这些基因中,挑选出8个表现H3K9 me3明显的基因,然后再从这8个基因中挑选出两个心脏和脾脏间表现H3K9 me3差异最明显的基因,分别是PTPN3和RBMS.结论 H3K9 me3差异可作为一个潜在的生物标志物或是表观遗传疾病的治疗靶点.
目的 分析人體器官心髒和脾髒的H3K9me3的全基因圖譜,以期髮現H3K9三甲基化的脩飾與組織特異性的錶達、功能和髮育具有相關性.方法 通過染色質免疫共沉澱的方法穫取各標本DNA,通過qPCR驗證ChIP結果,然後構建ChIP Sequencing文庫,與目的基因組序列比對,穫取比對Reads,接著進行全基因組的Peak分析,GO功能富集分析peak相關基因的生物學功能.結果 心髒和脾髒間有169箇基因有顯著地H3 K9me3差異,其中心髒中H3 K9me3的基因中有64箇特殊基因,脾髒中H3 K9 me3的基因中有87箇特殊基因.從這些基因中,挑選齣8箇錶現H3K9 me3明顯的基因,然後再從這8箇基因中挑選齣兩箇心髒和脾髒間錶現H3K9 me3差異最明顯的基因,分彆是PTPN3和RBMS.結論 H3K9 me3差異可作為一箇潛在的生物標誌物或是錶觀遺傳疾病的治療靶點.
목적 분석인체기관심장화비장적H3K9me3적전기인도보,이기발현H3K9삼갑기화적수식여조직특이성적표체、공능화발육구유상관성.방법 통과염색질면역공침정적방법획취각표본DNA,통과qPCR험증ChIP결과,연후구건ChIP Sequencing문고,여목적기인조서렬비대,획취비대Reads,접착진행전기인조적Peak분석,GO공능부집분석peak상관기인적생물학공능.결과 심장화비장간유169개기인유현저지H3 K9me3차이,기중심장중H3 K9me3적기인중유64개특수기인,비장중H3 K9 me3적기인중유87개특수기인.종저사기인중,도선출8개표현H3K9 me3명현적기인,연후재종저8개기인중도선출량개심장화비장간표현H3K9 me3차이최명현적기인,분별시PTPN3화RBMS.결론 H3K9 me3차이가작위일개잠재적생물표지물혹시표관유전질병적치료파점.
