微生物学杂志
微生物學雜誌
미생물학잡지
JOURNAL OF MICROBIOLOGY
2014年
2期
17-23
,共7页
张晓琳%刘峰%姚月婷%李亚东%周竞贤%易力%姚宇峰%俞建昆
張曉琳%劉峰%姚月婷%李亞東%週競賢%易力%姚宇峰%俞建昆
장효림%류봉%요월정%리아동%주경현%역력%요우봉%유건곤
HPV-16%E6基因突变%E7基因突变
HPV-16%E6基因突變%E7基因突變
HPV-16%E6기인돌변%E7기인돌변
HPV-16%E6 gene mutation%E7 gene mutation
人乳头瘤病毒(Human papillomavirus,HPV) 16型(HPV-16)是引起宫颈癌的一种主要高危型病毒,其2个致癌基因E6和E7的核酸序列变异可能会影响其对宿主细胞的致癌性,已有研究表明其序列突变呈现地域差异性.因此,研究不同地域HPV-16这2个基因的变化情况是宫颈癌流行病学调研的主要内容,也可为研究E6和E7的致癌性积累数据.研究以NCBI登录号为NC_001526.2的HPV-16型病毒的序列为参照,采用Neighbor-joining方法对云南地区74例HPV-16样本的E6、E7的DNA序列构建进化树,结果显示:只有亚洲和欧洲变异亚型,而没有发现非洲1、非洲2、亚-美洲和北美洲这4种变异亚型.DNA序列分析显示:E6的碱基突变以T178G(D25E,59,46%)和T350G(L83V,8.11%)为主,E7的碱基突变主要以A647G(N29S,59.46%)和T846C(同义突变,60.81%)为主.发现E6的新突变有A95G(同义突变,1.35%)和A135G(K11R,1.35%);E7的新突变有C625T(L22F,1.35%)、C627T(同义突变,12.16%)、G689A(G43E,1.35%)、T748G(S63A,1.35%).此外还发现有一个共突变现象:T178G(D25E,59.46%)-A647G(N29S,59.46%)-T843C(同义突变,21.62%)-T846C(同义突变,60.81%).
人乳頭瘤病毒(Human papillomavirus,HPV) 16型(HPV-16)是引起宮頸癌的一種主要高危型病毒,其2箇緻癌基因E6和E7的覈痠序列變異可能會影響其對宿主細胞的緻癌性,已有研究錶明其序列突變呈現地域差異性.因此,研究不同地域HPV-16這2箇基因的變化情況是宮頸癌流行病學調研的主要內容,也可為研究E6和E7的緻癌性積纍數據.研究以NCBI登錄號為NC_001526.2的HPV-16型病毒的序列為參照,採用Neighbor-joining方法對雲南地區74例HPV-16樣本的E6、E7的DNA序列構建進化樹,結果顯示:隻有亞洲和歐洲變異亞型,而沒有髮現非洲1、非洲2、亞-美洲和北美洲這4種變異亞型.DNA序列分析顯示:E6的堿基突變以T178G(D25E,59,46%)和T350G(L83V,8.11%)為主,E7的堿基突變主要以A647G(N29S,59.46%)和T846C(同義突變,60.81%)為主.髮現E6的新突變有A95G(同義突變,1.35%)和A135G(K11R,1.35%);E7的新突變有C625T(L22F,1.35%)、C627T(同義突變,12.16%)、G689A(G43E,1.35%)、T748G(S63A,1.35%).此外還髮現有一箇共突變現象:T178G(D25E,59.46%)-A647G(N29S,59.46%)-T843C(同義突變,21.62%)-T846C(同義突變,60.81%).
인유두류병독(Human papillomavirus,HPV) 16형(HPV-16)시인기궁경암적일충주요고위형병독,기2개치암기인E6화E7적핵산서렬변이가능회영향기대숙주세포적치암성,이유연구표명기서렬돌변정현지역차이성.인차,연구불동지역HPV-16저2개기인적변화정황시궁경암류행병학조연적주요내용,야가위연구E6화E7적치암성적루수거.연구이NCBI등록호위NC_001526.2적HPV-16형병독적서렬위삼조,채용Neighbor-joining방법대운남지구74례HPV-16양본적E6、E7적DNA서렬구건진화수,결과현시:지유아주화구주변이아형,이몰유발현비주1、비주2、아-미주화북미주저4충변이아형.DNA서렬분석현시:E6적감기돌변이T178G(D25E,59,46%)화T350G(L83V,8.11%)위주,E7적감기돌변주요이A647G(N29S,59.46%)화T846C(동의돌변,60.81%)위주.발현E6적신돌변유A95G(동의돌변,1.35%)화A135G(K11R,1.35%);E7적신돌변유C625T(L22F,1.35%)、C627T(동의돌변,12.16%)、G689A(G43E,1.35%)、T748G(S63A,1.35%).차외환발현유일개공돌변현상:T178G(D25E,59.46%)-A647G(N29S,59.46%)-T843C(동의돌변,21.62%)-T846C(동의돌변,60.81%).