微生物学杂志
微生物學雜誌
미생물학잡지
JOURNAL OF MICROBIOLOGY
2014年
2期
7-11
,共5页
嗜酸氧化亚铁硫杆菌%细胞色素C4型蛋白%实时荧光定量PCR%生物信息学
嗜痠氧化亞鐵硫桿菌%細胞色素C4型蛋白%實時熒光定量PCR%生物信息學
기산양화아철류간균%세포색소C4형단백%실시형광정량PCR%생물신식학
Acidithiobacillus ferrooxidans%cytochrome C4 protein%qRT-PCR%bioinformatics
嗜酸氧化亚铁硫杆菌是一种极为重要的浸矿微生物,具有氧化各种还原性含硫物及亚铁等功能.采用实时荧光定量PCR技术及生物信息学等手段对该菌一个涉及铁硫氧化由afe_0378基因编码的细胞色素C家族蛋白CycA2进行了研究.结果表明,afe_0378基因在单质硫培养条件下转录水平是亚铁培养条件下的2.67倍.生物信息学分析表明afe_0378编码蛋白CycA2是分子质量为22.959 ku,pI为9.75的结合内膜的周质蛋白,二级结构为全α-螺旋,无β-折叠,包含2个相似结构域及N端一段跨膜疏水螺旋,属于细胞色素C4型蛋白家族.CycA2蛋白分子三维结构模建表明,双血红素与CycA2蛋白序列片段域C48-X-X-C51-H52及C149-X-X-C152-H153中的半胱氨酸共价连接.结合该菌硫代谢背景知识,推测CycA2蛋白的功能是介导细胞色素bc1复合体及终端氧化酶细胞色素aa3复合体之间的电子传递而参与硫代谢.
嗜痠氧化亞鐵硫桿菌是一種極為重要的浸礦微生物,具有氧化各種還原性含硫物及亞鐵等功能.採用實時熒光定量PCR技術及生物信息學等手段對該菌一箇涉及鐵硫氧化由afe_0378基因編碼的細胞色素C傢族蛋白CycA2進行瞭研究.結果錶明,afe_0378基因在單質硫培養條件下轉錄水平是亞鐵培養條件下的2.67倍.生物信息學分析錶明afe_0378編碼蛋白CycA2是分子質量為22.959 ku,pI為9.75的結閤內膜的週質蛋白,二級結構為全α-螺鏇,無β-摺疊,包含2箇相似結構域及N耑一段跨膜疏水螺鏇,屬于細胞色素C4型蛋白傢族.CycA2蛋白分子三維結構模建錶明,雙血紅素與CycA2蛋白序列片段域C48-X-X-C51-H52及C149-X-X-C152-H153中的半胱氨痠共價連接.結閤該菌硫代謝揹景知識,推測CycA2蛋白的功能是介導細胞色素bc1複閤體及終耑氧化酶細胞色素aa3複閤體之間的電子傳遞而參與硫代謝.
기산양화아철류간균시일충겁위중요적침광미생물,구유양화각충환원성함류물급아철등공능.채용실시형광정량PCR기술급생물신식학등수단대해균일개섭급철류양화유afe_0378기인편마적세포색소C가족단백CycA2진행료연구.결과표명,afe_0378기인재단질류배양조건하전록수평시아철배양조건하적2.67배.생물신식학분석표명afe_0378편마단백CycA2시분자질량위22.959 ku,pI위9.75적결합내막적주질단백,이급결구위전α-라선,무β-절첩,포함2개상사결구역급N단일단과막소수라선,속우세포색소C4형단백가족.CycA2단백분자삼유결구모건표명,쌍혈홍소여CycA2단백서렬편단역C48-X-X-C51-H52급C149-X-X-C152-H153중적반광안산공개련접.결합해균류대사배경지식,추측CycA2단백적공능시개도세포색소bc1복합체급종단양화매세포색소aa3복합체지간적전자전체이삼여류대사.
