中国牛业科学
中國牛業科學
중국우업과학
CHINA CATTLE SCIENCE
2014年
3期
15-20
,共6页
江明星%哈福%付琳%袁峰%欧阳依娜%张慧芳%苗永旺
江明星%哈福%付琳%袁峰%歐暘依娜%張慧芳%苗永旺
강명성%합복%부림%원봉%구양의나%장혜방%묘영왕
水牛%FASN基因%多态性%SNPs%比较基因组学分析
水牛%FASN基因%多態性%SNPs%比較基因組學分析
수우%FASN기인%다태성%SNPs%비교기인조학분석
[目的]脂肪酸合成酶(Fatty acid synthase,FASN)是影响哺乳动物脂肪酸合成的关键酶,但有关水牛FASN基因的群体遗传组成特征还不清楚.[方法]本研究采用PCR产物直接测序法和PCR-SSCP方法对88头河流型和122头沼泽型水牛、54头牦牛和40头大额牛FASN基因外显子37进行群体变异检测,并结合已发表的牛科物种序列进行生物信息学分析.[结果]结果表明,仅在水牛中发现2个SNP位点,为c.6363 C＞T和c.6372 C＞T,均为同义替换.河流型和沼泽型水牛共享这2个SNP位点,但它们在两类水牛中的群体遗传组成不同.确定水牛特有的核苷酸位点3个,即c.6183A,c.6255T和c.6394A,其中c.6394A导致水牛FASN蛋白第2132位氨基酸与其它牛科物种不同,在水牛中为M而其它牛科物种中为V;山羊特有的位点2个,为c.6189A和c.6267T.普通牛、山羊和绵羊中具有异义替换SNP位点,分别为1个、3个和7个.普通牛的异义替换SNP位点c.6365 G＞A对蛋白质功能影响不显著(subPSEC＞-3);山羊的这些异义替换SNP位点c.6296 T＞C、c.6301 C＞T和c.6341 T＞C对其蛋白质功能影响均有显著影响(subPSEC＜-3);绵羊7个异义替换SNP位点中的2个,即c.6286 A＞C和c.6406 A＞G对FASN功能有显著影响(subPSEC＜-3).[结论]这些核苷酸差异引起的氨基酸差异可能引起不同牛科物种间FASN功能的差异.
[目的]脂肪痠閤成酶(Fatty acid synthase,FASN)是影響哺乳動物脂肪痠閤成的關鍵酶,但有關水牛FASN基因的群體遺傳組成特徵還不清楚.[方法]本研究採用PCR產物直接測序法和PCR-SSCP方法對88頭河流型和122頭沼澤型水牛、54頭牦牛和40頭大額牛FASN基因外顯子37進行群體變異檢測,併結閤已髮錶的牛科物種序列進行生物信息學分析.[結果]結果錶明,僅在水牛中髮現2箇SNP位點,為c.6363 C＞T和c.6372 C＞T,均為同義替換.河流型和沼澤型水牛共享這2箇SNP位點,但它們在兩類水牛中的群體遺傳組成不同.確定水牛特有的覈苷痠位點3箇,即c.6183A,c.6255T和c.6394A,其中c.6394A導緻水牛FASN蛋白第2132位氨基痠與其它牛科物種不同,在水牛中為M而其它牛科物種中為V;山羊特有的位點2箇,為c.6189A和c.6267T.普通牛、山羊和綿羊中具有異義替換SNP位點,分彆為1箇、3箇和7箇.普通牛的異義替換SNP位點c.6365 G＞A對蛋白質功能影響不顯著(subPSEC＞-3);山羊的這些異義替換SNP位點c.6296 T＞C、c.6301 C＞T和c.6341 T＞C對其蛋白質功能影響均有顯著影響(subPSEC＜-3);綿羊7箇異義替換SNP位點中的2箇,即c.6286 A＞C和c.6406 A＞G對FASN功能有顯著影響(subPSEC＜-3).[結論]這些覈苷痠差異引起的氨基痠差異可能引起不同牛科物種間FASN功能的差異.
[목적]지방산합성매(Fatty acid synthase,FASN)시영향포유동물지방산합성적관건매,단유관수우FASN기인적군체유전조성특정환불청초.[방법]본연구채용PCR산물직접측서법화PCR-SSCP방법대88두하류형화122두소택형수우、54두모우화40두대액우FASN기인외현자37진행군체변이검측,병결합이발표적우과물충서렬진행생물신식학분석.[결과]결과표명,부재수우중발현2개SNP위점,위c.6363 C＞T화c.6372 C＞T,균위동의체환.하류형화소택형수우공향저2개SNP위점,단타문재량류수우중적군체유전조성불동.학정수우특유적핵감산위점3개,즉c.6183A,c.6255T화c.6394A,기중c.6394A도치수우FASN단백제2132위안기산여기타우과물충불동,재수우중위M이기타우과물충중위V;산양특유적위점2개,위c.6189A화c.6267T.보통우、산양화면양중구유이의체환SNP위점,분별위1개、3개화7개.보통우적이의체환SNP위점c.6365 G＞A대단백질공능영향불현저(subPSEC＞-3);산양적저사이의체환SNP위점c.6296 T＞C、c.6301 C＞T화c.6341 T＞C대기단백질공능영향균유현저영향(subPSEC＜-3);면양7개이의체환SNP위점중적2개,즉c.6286 A＞C화c.6406 A＞G대FASN공능유현저영향(subPSEC＜-3).[결론]저사핵감산차이인기적안기산차이가능인기불동우과물충간FASN공능적차이.
