安徽农业科学
安徽農業科學
안휘농업과학
JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES
2013年
36期
13847-13850
,共4页
大豆%基因组勘探序列%保守序列%综合保守序列%综合保守序列扩增多态性
大豆%基因組勘探序列%保守序列%綜閤保守序列%綜閤保守序列擴增多態性
대두%기인조감탐서렬%보수서렬%종합보수서렬%종합보수서렬확증다태성
Soybean%Genome survey sequence%Conserved sequence%Integrative conserved sequence%Integrative conserved sequence amplified polymorphism
采用VBA程序查找了大豆基因组保守序列——在基因组中出现次数较多的碱基序列片段,分析了这类保守序列的基本特性,在此基础上,设计了一种新型分子标记——综合保守序列扩增多态性分子标记.碱基数目越多,保守序列种类数和出现次数越少,从10个碱基到27个碱基,保守序列的GC含量先是逐渐增加,达到一个平台后又逐渐降低.碱基离保守序列3'端越近,出现A或T的可能性越大,碱基在保守序列中的分布具有非随机性.不同长度的保守序列具有明显的进化关系.筛选出10个碱基的保守序列和长度为8个碱基的填充序列用来设计引物,共得到566对引物组合.该新型分子标记有望在条带多态性、引物一致性等方面超越现有分子标记,同时具有成本低廉等优点.该研究旨在为基因组保守序列查找和分子标记设计方面提供新的思路,分析这些保守序列特性有助于进一步探索分子进化机理.该新型分子标记有可能在大豆种质资源鉴定和基因图位克隆等方面得到应用,同时该分析方法也适用对其他物种.
採用VBA程序查找瞭大豆基因組保守序列——在基因組中齣現次數較多的堿基序列片段,分析瞭這類保守序列的基本特性,在此基礎上,設計瞭一種新型分子標記——綜閤保守序列擴增多態性分子標記.堿基數目越多,保守序列種類數和齣現次數越少,從10箇堿基到27箇堿基,保守序列的GC含量先是逐漸增加,達到一箇平檯後又逐漸降低.堿基離保守序列3'耑越近,齣現A或T的可能性越大,堿基在保守序列中的分佈具有非隨機性.不同長度的保守序列具有明顯的進化關繫.篩選齣10箇堿基的保守序列和長度為8箇堿基的填充序列用來設計引物,共得到566對引物組閤.該新型分子標記有望在條帶多態性、引物一緻性等方麵超越現有分子標記,同時具有成本低廉等優點.該研究旨在為基因組保守序列查找和分子標記設計方麵提供新的思路,分析這些保守序列特性有助于進一步探索分子進化機理.該新型分子標記有可能在大豆種質資源鑒定和基因圖位剋隆等方麵得到應用,同時該分析方法也適用對其他物種.
채용VBA정서사조료대두기인조보수서렬——재기인조중출현차수교다적감기서렬편단,분석료저류보수서렬적기본특성,재차기출상,설계료일충신형분자표기——종합보수서렬확증다태성분자표기.감기수목월다,보수서렬충류수화출현차수월소,종10개감기도27개감기,보수서렬적GC함량선시축점증가,체도일개평태후우축점강저.감기리보수서렬3'단월근,출현A혹T적가능성월대,감기재보수서렬중적분포구유비수궤성.불동장도적보수서렬구유명현적진화관계.사선출10개감기적보수서렬화장도위8개감기적전충서렬용래설계인물,공득도566대인물조합.해신형분자표기유망재조대다태성、인물일치성등방면초월현유분자표기,동시구유성본저렴등우점.해연구지재위기인조보수서렬사조화분자표기설계방면제공신적사로,분석저사보수서렬특성유조우진일보탐색분자진화궤리.해신형분자표기유가능재대두충질자원감정화기인도위극륭등방면득도응용,동시해분석방법야괄용대기타물충.
