北京生物医学工程
北京生物醫學工程
북경생물의학공정
BEIJING BIOMEDICAL ENGINEERING
2014年
2期
139-143
,共5页
代谢网络%拓扑%模块%基元模块
代謝網絡%拓撲%模塊%基元模塊
대사망락%탁복%모괴%기원모괴
metabolic network%topology%module%elementary module
目的 为提取出物种代谢网络具有的基本结构模块即基元模块,提出一种基于拓扑结构的发现代谢网络基元模块方法.方法 首先利用网络模块化方法将不同物种的代谢网络划分为模块集合,然后通过合并相似的模块以及分解较大的代表模块等操作,最终获得基元模块集合.同时,利用超几何假设检验的方法以确定模块所具有的代谢功能,并在此基础上验证发现基元模块方法的合理性.结果 对KEGG数据库中的1452个物种代谢网络经上述方法处理后,最终得到11446个基元模块,并且这些基元模块能够很好地表示代谢网络.结论 提出了一种基于代谢网络拓扑结构的发现基元模块的方法,该方法能够有效提取出组成物种代谢网络的基元模块.
目的 為提取齣物種代謝網絡具有的基本結構模塊即基元模塊,提齣一種基于拓撲結構的髮現代謝網絡基元模塊方法.方法 首先利用網絡模塊化方法將不同物種的代謝網絡劃分為模塊集閤,然後通過閤併相似的模塊以及分解較大的代錶模塊等操作,最終穫得基元模塊集閤.同時,利用超幾何假設檢驗的方法以確定模塊所具有的代謝功能,併在此基礎上驗證髮現基元模塊方法的閤理性.結果 對KEGG數據庫中的1452箇物種代謝網絡經上述方法處理後,最終得到11446箇基元模塊,併且這些基元模塊能夠很好地錶示代謝網絡.結論 提齣瞭一種基于代謝網絡拓撲結構的髮現基元模塊的方法,該方法能夠有效提取齣組成物種代謝網絡的基元模塊.
목적 위제취출물충대사망락구유적기본결구모괴즉기원모괴,제출일충기우탁복결구적발현대사망락기원모괴방법.방법 수선이용망락모괴화방법장불동물충적대사망락화분위모괴집합,연후통과합병상사적모괴이급분해교대적대표모괴등조작,최종획득기원모괴집합.동시,이용초궤하가설검험적방법이학정모괴소구유적대사공능,병재차기출상험증발현기원모괴방법적합이성.결과 대KEGG수거고중적1452개물충대사망락경상술방법처리후,최종득도11446개기원모괴,병차저사기원모괴능구흔호지표시대사망락.결론 제출료일충기우대사망락탁복결구적발현기원모괴적방법,해방법능구유효제취출조성물충대사망락적기원모괴.
