山西医科大学学报
山西醫科大學學報
산서의과대학학보
JOURNAL OF SHANXI MEDICAL UNIVERSITY
2014年
4期
251-254,339-340
,共6页
于保锋%刘志贞%张悦红%解军%程牛亮%王建华%牛勃
于保鋒%劉誌貞%張悅紅%解軍%程牛亮%王建華%牛勃
우보봉%류지정%장열홍%해군%정우량%왕건화%우발
赤子爱胜蚓%Eisenstasin样蛋白%cDNA%序列分析
赤子愛勝蚓%Eisenstasin樣蛋白%cDNA%序列分析
적자애성인%Eisenstasin양단백%cDNA%서렬분석
Eisenia foetida%Eisenstasin-like protein%cDNA%sequence analysis
目的 对赤子爱胜蚓Eisenstasin样蛋白cDNA序列和氨基酸序列进行综合分析,为其结构和功能的研究奠定理论基础.方法 从赤子爱胜蚓cDNA文库中随机测序获得目标cDNA序列,利用基因和蛋白质分析处理软件DNAMAN、NCBIORF finder、BLAST、Conserved Domains、GOR、SWISS-MODEL等软件对该目标的基因序列和氨基酸序列进行综合分析.结果 测序获得的赤子爱胜蚓Eisenstasin样蛋白cDNA序列长为565 bp,编码148个氨基酸残基,基因序列比对显示该蛋白与Eisenstasin I mRNA的编码序列同源度最高,两者核苷酸的相似度为78％ (148/190),氨基酸序列比对显示该蛋白与Eisenstasin Ⅱ的氨基酸序列同源度最高,两者氨基酸的相似度为37％ (61/166),目标序列中存在3段Antistasin家族保守结构域,二级结构和三级结构预测显示目标蛋白中主要存在β折叠和无规卷曲的结构,与Antistasin的预测结果高度相似. 结论 经多种生物软件分析,可以认为本次发现的Eisenstasin样蛋白与安德爱胜蚓组织中发现的Eisenstasin和水蛭中发现的Antistasin同源度高,可能具有抗凝功能.
目的 對赤子愛勝蚓Eisenstasin樣蛋白cDNA序列和氨基痠序列進行綜閤分析,為其結構和功能的研究奠定理論基礎.方法 從赤子愛勝蚓cDNA文庫中隨機測序穫得目標cDNA序列,利用基因和蛋白質分析處理軟件DNAMAN、NCBIORF finder、BLAST、Conserved Domains、GOR、SWISS-MODEL等軟件對該目標的基因序列和氨基痠序列進行綜閤分析.結果 測序穫得的赤子愛勝蚓Eisenstasin樣蛋白cDNA序列長為565 bp,編碼148箇氨基痠殘基,基因序列比對顯示該蛋白與Eisenstasin I mRNA的編碼序列同源度最高,兩者覈苷痠的相似度為78％ (148/190),氨基痠序列比對顯示該蛋白與Eisenstasin Ⅱ的氨基痠序列同源度最高,兩者氨基痠的相似度為37％ (61/166),目標序列中存在3段Antistasin傢族保守結構域,二級結構和三級結構預測顯示目標蛋白中主要存在β摺疊和無規捲麯的結構,與Antistasin的預測結果高度相似. 結論 經多種生物軟件分析,可以認為本次髮現的Eisenstasin樣蛋白與安德愛勝蚓組織中髮現的Eisenstasin和水蛭中髮現的Antistasin同源度高,可能具有抗凝功能.
목적 대적자애성인Eisenstasin양단백cDNA서렬화안기산서렬진행종합분석,위기결구화공능적연구전정이론기출.방법 종적자애성인cDNA문고중수궤측서획득목표cDNA서렬,이용기인화단백질분석처리연건DNAMAN、NCBIORF finder、BLAST、Conserved Domains、GOR、SWISS-MODEL등연건대해목표적기인서렬화안기산서렬진행종합분석.결과 측서획득적적자애성인Eisenstasin양단백cDNA서렬장위565 bp,편마148개안기산잔기,기인서렬비대현시해단백여Eisenstasin I mRNA적편마서렬동원도최고,량자핵감산적상사도위78％ (148/190),안기산서렬비대현시해단백여Eisenstasin Ⅱ적안기산서렬동원도최고,량자안기산적상사도위37％ (61/166),목표서렬중존재3단Antistasin가족보수결구역,이급결구화삼급결구예측현시목표단백중주요존재β절첩화무규권곡적결구,여Antistasin적예측결과고도상사. 결론 경다충생물연건분석,가이인위본차발현적Eisenstasin양단백여안덕애성인조직중발현적Eisenstasin화수질중발현적Antistasin동원도고,가능구유항응공능.
