昆明理工大学学报(自然科学版)
昆明理工大學學報(自然科學版)
곤명리공대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF KUNMING UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY(SCIENCE AND TECHNOLOGY)
2014年
2期
79-85
,共7页
张金阳%孙涛%杨光文%宋玉竹%韩芹芹%夏雪山
張金暘%孫濤%楊光文%宋玉竹%韓芹芹%夏雪山
장금양%손도%양광문%송옥죽%한근근%하설산
猴B病毒%gG蛋白%生物信息学%B细胞表位%抗原%疫苗
猴B病毒%gG蛋白%生物信息學%B細胞錶位%抗原%疫苗
후B병독%gG단백%생물신식학%B세포표위%항원%역묘
monkey herpes B virus%gG protein%bioinformatics%B cell epitope%antigen%vaccine
为了探讨猴B病毒gG基因编码蛋白作为疫苗候选抗原和ELISA试剂盒研制所需检测用抗原的可能性,本研究从Genbank数据库中获得猴B病毒gG基因序列,采用IEDB、SOSUI等在线分析系统对该基因序列的编码区进行生物信息学分析,并预测gG基因编码蛋白的理化性质、可溶性和表面可及性、跨膜区、抗原表位以及线性B细胞表位等。分析结果表明,B病毒gG蛋白为膜蛋白,具有一个跨膜螺旋,以及较为丰富的β-转角,为可溶性蛋白,蛋白序列中具有多个抗原表位和优势线性B细胞表位,有作为猴B病毒疫苗候选抗原和抗体诊断用抗原的潜力。
為瞭探討猴B病毒gG基因編碼蛋白作為疫苗候選抗原和ELISA試劑盒研製所需檢測用抗原的可能性,本研究從Genbank數據庫中穫得猴B病毒gG基因序列,採用IEDB、SOSUI等在線分析繫統對該基因序列的編碼區進行生物信息學分析,併預測gG基因編碼蛋白的理化性質、可溶性和錶麵可及性、跨膜區、抗原錶位以及線性B細胞錶位等。分析結果錶明,B病毒gG蛋白為膜蛋白,具有一箇跨膜螺鏇,以及較為豐富的β-轉角,為可溶性蛋白,蛋白序列中具有多箇抗原錶位和優勢線性B細胞錶位,有作為猴B病毒疫苗候選抗原和抗體診斷用抗原的潛力。
위료탐토후B병독gG기인편마단백작위역묘후선항원화ELISA시제합연제소수검측용항원적가능성,본연구종Genbank수거고중획득후B병독gG기인서렬,채용IEDB、SOSUI등재선분석계통대해기인서렬적편마구진행생물신식학분석,병예측gG기인편마단백적이화성질、가용성화표면가급성、과막구、항원표위이급선성B세포표위등。분석결과표명,B병독gG단백위막단백,구유일개과막라선,이급교위봉부적β-전각,위가용성단백,단백서렬중구유다개항원표위화우세선성B세포표위,유작위후B병독역묘후선항원화항체진단용항원적잠력。
To explore the possibility of the monkey B virus gG gene encoded protein as a vaccine candidate anti-gen and detecting antigen for ELISA kits development,monkey herpes B virus gG gene sequences is firstly down-load from Genbank database.Online analysis system IEDB and SOSUI are then adopted for the gene sequence bioinformatic analysis of the coding region.The prediction is carried out on protein encoded gG gene physico-chemical properties,solubility and surface accessibility,transmembrane region epitopes and linear B -cell epitopes.The results show that membrane protein gG protein herpes B virus is a soluble protein,having a trans-membrane helix,and relatively richβ-corners,whose protein sequence has a plurality of antigenic epitopes and dominant B-cell linear epitopes.It has the potential to serve as a monkey B virus vaccine candidate antigen and antibody diagnostic antigen.