东北林业大学学报
東北林業大學學報
동북임업대학학보
JOURNAL OF NORTHEAST FORESTRY UNIVERSITY
2014年
4期
21-25
,共5页
曹宁%张启翔%郝瑞杰%徐宗大%王涛%杨炜茹
曹寧%張啟翔%郝瑞傑%徐宗大%王濤%楊煒茹
조저%장계상%학서걸%서종대%왕도%양위여
梅花%ICE1转录因子基因%抗寒性%实时荧光定量PCR
梅花%ICE1轉錄因子基因%抗寒性%實時熒光定量PCR
매화%ICE1전록인자기인%항한성%실시형광정량PCR
Prunus mume%ICE1 transcription factor gene%Cold resistance%Relative real-timePCR
以梅花( Prunus mume)品种‘三轮玉蝶’为试材,根据苹果( Malus domestica) MdCIbHLH1基因序列在梅花基因组数据库中搜索同源序列并设计引物,通过PCR、RT-PCR获得ICE1基因的DNA、cDNA全长序列。 cD-NA全长1626 bp,含有完整的开放阅读框,编码541个氨基酸,基因编码区上存在3个内含子和4个外显子,含有bHLH区、富S区、核定位信号区( NLS)和转膜区。 ExSAPy在线预测编码蛋白呈亲水性,亚细胞定位预测目的蛋白位于细胞核(98%)。 BLAST分析结果表明,其cDNA序列及推导的氨基酸序列均与苹果、茶( Camellia sinensis)、甜杨(Populus suaveolens)、枳(Poncirus trifoliata)等物种的ICE1具有较高同源性,推断克隆到的cDNA可能是梅花ICE 1基因,命名为PmICE1。实时荧光定量分析结果表明,在4℃低温胁迫下,PmICE1基因表达量随胁迫时间的延长呈上升趋势,16 h时达到峰值,说明该基因在低温胁迫下呈上调表达。
以梅花( Prunus mume)品種‘三輪玉蝶’為試材,根據蘋果( Malus domestica) MdCIbHLH1基因序列在梅花基因組數據庫中搜索同源序列併設計引物,通過PCR、RT-PCR穫得ICE1基因的DNA、cDNA全長序列。 cD-NA全長1626 bp,含有完整的開放閱讀框,編碼541箇氨基痠,基因編碼區上存在3箇內含子和4箇外顯子,含有bHLH區、富S區、覈定位信號區( NLS)和轉膜區。 ExSAPy在線預測編碼蛋白呈親水性,亞細胞定位預測目的蛋白位于細胞覈(98%)。 BLAST分析結果錶明,其cDNA序列及推導的氨基痠序列均與蘋果、茶( Camellia sinensis)、甜楊(Populus suaveolens)、枳(Poncirus trifoliata)等物種的ICE1具有較高同源性,推斷剋隆到的cDNA可能是梅花ICE 1基因,命名為PmICE1。實時熒光定量分析結果錶明,在4℃低溫脅迫下,PmICE1基因錶達量隨脅迫時間的延長呈上升趨勢,16 h時達到峰值,說明該基因在低溫脅迫下呈上調錶達。
이매화( Prunus mume)품충‘삼륜옥접’위시재,근거평과( Malus domestica) MdCIbHLH1기인서렬재매화기인조수거고중수색동원서렬병설계인물,통과PCR、RT-PCR획득ICE1기인적DNA、cDNA전장서렬。 cD-NA전장1626 bp,함유완정적개방열독광,편마541개안기산,기인편마구상존재3개내함자화4개외현자,함유bHLH구、부S구、핵정위신호구( NLS)화전막구。 ExSAPy재선예측편마단백정친수성,아세포정위예측목적단백위우세포핵(98%)。 BLAST분석결과표명,기cDNA서렬급추도적안기산서렬균여평과、다( Camellia sinensis)、첨양(Populus suaveolens)、지(Poncirus trifoliata)등물충적ICE1구유교고동원성,추단극륭도적cDNA가능시매화ICE 1기인,명명위PmICE1。실시형광정량분석결과표명,재4℃저온협박하,PmICE1기인표체량수협박시간적연장정상승추세,16 h시체도봉치,설명해기인재저온협박하정상조표체。
A putative sequence of ICE1 gene was identified in the genome database of Prunu mume according to the ICE1 tran-scription factor of Apple (Malus domestica) MdCIbHLH 1 gene.ICE1 gene was isolated from Prunus mume ‘San Lun Yu Die’ by PCR and RT-PCR.A 1 626-bp cDNA clone was obtained including a putatively entire open reading frame (ORF) and encodes a protein of 541 amino acids.The coding regions of the gene include three introns and four exons.The predic-ted PmICE1 protein contains a typical bHLH domain, a serine-rich region (S-rich), a nuclear localization signal (NLS), a transmembrane domain, N-glycosylation and kinase phosphorylation sites.ExSAPy online predictive coding protein is hy-drophilic.The possibility of location in the nucleus is 98%according to the subcellular localization prediction.By bioin-formatics analysis, the cDNA is highly homologous to ICE1 from Malus domestica, Camellia sinensis, Poncirus trifoliata and Populus suaveolens, and the cloned sequence may be a new member of ICE1 gene in Prunus mume.By relative real-time PCR experiment , the expression of PmICE1 gene increases at 4 ℃ at beginning and achieves the highest after 16 hours.Therefore, PmICE1 increases under low temperature stress.