CAJ | 학술논문

1996～2008年从我国不同地区分离30株传染性支气管炎病毒(Infectious Bronchitis Viruses,IBV)野毒株的M基因,采用RT-PCR方法克隆测定所分离的野毒株和澳大利亚T株的M基因序列,利用生物信息学软件与GenBank中公布的部分国内外IBV毒株的M基因序列进行比较分析,研究我国IBV的分子流行学特点和分子遗传变异规律.结果发现所测毒株M基因具有4种不同长度的开放阅读框:669 bp、672 bp、678 bp和681 bp,分别编码222、223、225和226个氨基酸的多肽,这些长度的差异是由5′端的核苷酸插入或缺失造成的.30个IBV分离株间的同源性在89.5%～100%之间.以疫苗株H120氨基酸位置为参照,在被比较的73株IBV M蛋白中发现62个位点存在变异,其中以2～5、10～16、44～46、217～222等4个区域氨基酸取代率较高.系统进化分析显示,被比较的73个IBV毒株分为5个进化群,我国的IBV分属于其中的4个群,其中第一群和第四群与我国所使用的疫苗病毒株相距较远.同时发现部分近年的分离株与10多年前分离株具有很近遗传进化关系.从M基因看,在我国出现了多种基因型IBV共存的现象,分离株与疫苗株的遗传差异提示我们需要对疫苗的选用做出重新评估.
1996～2008년종아국불동지구분리30주전염성지기관염병독(Infectious Bronchitis Viruses,IBV)야독주적M기인,채용RT-PCR방법극륭측정소분리적야독주화오대리아T주적M기인서렬,이용생물신식학연건여GenBank중공포적부분국내외IBV독주적M기인서렬진행비교분석,연구아국IBV적분자류행학특점화분자유전변이규률.결과발현소측독주M기인구유4충불동장도적개방열독광:669 bp、672 bp、678 bp화681 bp,분별편마222、223、225화226개안기산적다태,저사장도적차이시유5′단적핵감산삽입혹결실조성적.30개IBV분리주간적동원성재89.5%～100%지간.이역묘주H120안기산위치위삼조,재피비교적73주IBV M단백중발현62개위점존재변이,기중이2～5、10～16、44～46、217～222등4개구역안기산취대솔교고.계통진화분석현시,피비교적73개IBV독주분위5개진화군,아국적IBV분속우기중적4개군,기중제일군화제사군여아국소사용적역묘병독주상거교원.동시발현부분근년적분리주여10다년전분리주구유흔근유전진화관계.종M기인간,재아국출현료다충기인형IBV공존적현상,분리주여역묘주적유전차이제시아문수요대역묘적선용주출중신평고.