生物技术通报
生物技術通報
생물기술통보
BIOTECHNOLOGY BULLETIN
2008年
4期
149-154
,共6页
磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶%生物信息学%蓝藻(蓝细茵)%生物柴油
燐痠烯醇式丙酮痠羧化酶%生物信息學%藍藻(藍細茵)%生物柴油
린산희순식병동산최화매%생물신식학%람조(람세인)%생물시유
应用NCBI、Expasy等在线生物信息学网站对蓝藻磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)与其他物种进行序列同源比对,分析相同的保守序列及催化活性位点,构建分子进化树;预测跨膜结构、疏水性/亲水性、二级结构、功能域和模体等.结果显示,蓝藻PEPC与高等植物、细菌、真核藻PEPC同源性都比较低(约为33%),但是它们含有两个类似的活性部位和相同的催化活性位点;该蛋白质是非跨膜的亲水性不稳定蛋白,二级结构以a-螺旋和无规则卷曲为主,舍有一个功能结构域,主要的功能是参与氨基酸的合成.
應用NCBI、Expasy等在線生物信息學網站對藍藻燐痠烯醇式丙酮痠羧化酶(PEPC)與其他物種進行序列同源比對,分析相同的保守序列及催化活性位點,構建分子進化樹;預測跨膜結構、疏水性/親水性、二級結構、功能域和模體等.結果顯示,藍藻PEPC與高等植物、細菌、真覈藻PEPC同源性都比較低(約為33%),但是它們含有兩箇類似的活性部位和相同的催化活性位點;該蛋白質是非跨膜的親水性不穩定蛋白,二級結構以a-螺鏇和無規則捲麯為主,捨有一箇功能結構域,主要的功能是參與氨基痠的閤成.
응용NCBI、Expasy등재선생물신식학망참대람조린산희순식병동산최화매(PEPC)여기타물충진행서렬동원비대,분석상동적보수서렬급최화활성위점,구건분자진화수;예측과막결구、소수성/친수성、이급결구、공능역화모체등.결과현시,람조PEPC여고등식물、세균、진핵조PEPC동원성도비교저(약위33%),단시타문함유량개유사적활성부위화상동적최화활성위점;해단백질시비과막적친수성불은정단백,이급결구이a-라선화무규칙권곡위주,사유일개공능결구역,주요적공능시삼여안기산적합성.
