山东建筑大学学报
山東建築大學學報
산동건축대학학보
JOURNAL OF SHANDONG JIANZHU UNIVERSITY
2013年
2期
101-105
,共5页
时术华%陈建中%张庆刚%张少龙
時術華%陳建中%張慶剛%張少龍
시술화%진건중%장경강%장소룡
物理化学%p53-MDM2相互作用%分子动力学模拟%相关矩阵%PMI
物理化學%p53-MDM2相互作用%分子動力學模擬%相關矩陣%PMI
물이화학%p53-MDM2상호작용%분자동역학모의%상관구진%PMI
physical chemistry%p53-MDM2 interaction%molecular dynamics simulation%cross-correlation matrixes%PMI
p53-MDM2相互作用已经成为治疗癌症药物设计的重要靶标.采用分子动力学模拟和MM-PBSA方法计算了肽类抑制剂PMI与MDM2的绝对结合自由能,通过基于残基的自由能分解方法计算了MDM2的各残基与PMI的相互作用.结果表明:CH-π、CH-CH和π-π相互作用驱动了PMI在MDM2疏水性裂缝中的结合;相关矩阵的计算表明PMI在一定程度上诱导了MDM2内部的相关运动.
p53-MDM2相互作用已經成為治療癌癥藥物設計的重要靶標.採用分子動力學模擬和MM-PBSA方法計算瞭肽類抑製劑PMI與MDM2的絕對結閤自由能,通過基于殘基的自由能分解方法計算瞭MDM2的各殘基與PMI的相互作用.結果錶明:CH-π、CH-CH和π-π相互作用驅動瞭PMI在MDM2疏水性裂縫中的結閤;相關矩陣的計算錶明PMI在一定程度上誘導瞭MDM2內部的相關運動.
p53-MDM2상호작용이경성위치료암증약물설계적중요파표.채용분자동역학모의화MM-PBSA방법계산료태류억제제PMI여MDM2적절대결합자유능,통과기우잔기적자유능분해방법계산료MDM2적각잔기여PMI적상호작용.결과표명:CH-π、CH-CH화π-π상호작용구동료PMI재MDM2소수성렬봉중적결합;상관구진적계산표명PMI재일정정도상유도료MDM2내부적상관운동.