农业生物技术学报
農業生物技術學報
농업생물기술학보
JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY
2010年
1期
66-74
,共9页
禹绍国%叶星%张莉莉%田园园%劳海华%白俊杰%卢迈新
禹紹國%葉星%張莉莉%田園園%勞海華%白俊傑%盧邁新
우소국%협성%장리리%전완완%로해화%백준걸%로매신
奥利亚罗非鱼%C型溶菌酶%蛋白质高级结构
奧利亞囉非魚%C型溶菌酶%蛋白質高級結構
오리아라비어%C형용균매%단백질고급결구
Oreochromis aureus%C-type lysozyme%protein tertiary structucture prediction
本研究结合RT-PCR和RACE法获得了奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)三种C型溶菌酶基因C-1,-2和C-3的全长cDNA.3个基因的cDNA分别为581 bp、662 bp和695 bp,各编码143、156和143个氨基酸(GenBank accession No:EU913095,EU913094和EU836689),相互间氨基酸序列的同源性在63.9%~67.8%之间.3个基因均具有与其它物种C型溶菌酶相同的8个保守半胱氨酸残基和2个活性位点Glu~(35)和Asp~(52),可认为它们均为C型溶菌酶基因.在系统进化树中这3个基因首先与同属高等真骨鱼类的聚类,最后再与低等真骨鱼类的聚类,系统进化关系与传统鱼类分类地位相吻合,显示真骨鱼类C型溶菌酶的进化速度与物种的进化速度基本一致.蛋白分析软件分析显示这3个基因均具有C型溶菌酶的典型结构、相似的蛋白二、三级结构,推测应具有与C型溶菌酶相似的生理功能.但3个基因氨基酸序列间存在一定差异,其中C-1的等电点较低且碱性氨基酸较少,因此3种溶菌酶可能具有生理功能上的差异与分工.
本研究結閤RT-PCR和RACE法穫得瞭奧利亞囉非魚(Oreochromis aureus)三種C型溶菌酶基因C-1,-2和C-3的全長cDNA.3箇基因的cDNA分彆為581 bp、662 bp和695 bp,各編碼143、156和143箇氨基痠(GenBank accession No:EU913095,EU913094和EU836689),相互間氨基痠序列的同源性在63.9%~67.8%之間.3箇基因均具有與其它物種C型溶菌酶相同的8箇保守半胱氨痠殘基和2箇活性位點Glu~(35)和Asp~(52),可認為它們均為C型溶菌酶基因.在繫統進化樹中這3箇基因首先與同屬高等真骨魚類的聚類,最後再與低等真骨魚類的聚類,繫統進化關繫與傳統魚類分類地位相吻閤,顯示真骨魚類C型溶菌酶的進化速度與物種的進化速度基本一緻.蛋白分析軟件分析顯示這3箇基因均具有C型溶菌酶的典型結構、相似的蛋白二、三級結構,推測應具有與C型溶菌酶相似的生理功能.但3箇基因氨基痠序列間存在一定差異,其中C-1的等電點較低且堿性氨基痠較少,因此3種溶菌酶可能具有生理功能上的差異與分工.
본연구결합RT-PCR화RACE법획득료오리아라비어(Oreochromis aureus)삼충C형용균매기인C-1,-2화C-3적전장cDNA.3개기인적cDNA분별위581 bp、662 bp화695 bp,각편마143、156화143개안기산(GenBank accession No:EU913095,EU913094화EU836689),상호간안기산서렬적동원성재63.9%~67.8%지간.3개기인균구유여기타물충C형용균매상동적8개보수반광안산잔기화2개활성위점Glu~(35)화Asp~(52),가인위타문균위C형용균매기인.재계통진화수중저3개기인수선여동속고등진골어류적취류,최후재여저등진골어류적취류,계통진화관계여전통어류분류지위상문합,현시진골어류C형용균매적진화속도여물충적진화속도기본일치.단백분석연건분석현시저3개기인균구유C형용균매적전형결구、상사적단백이、삼급결구,추측응구유여C형용균매상사적생리공능.단3개기인안기산서렬간존재일정차이,기중C-1적등전점교저차감성안기산교소,인차3충용균매가능구유생리공능상적차이여분공.
