CAJ | 학술논문

多聚半乳糖醛酸酶(polygalacturonase,PG)广泛存在于细菌、真菌和植物中,目前数据库中已积累了大量的序列资料.为了进一步了解PG基因家族的分子进化,以及其作为系统进化研究材料的可能性,本研究选取了88条来自不同物种包括细菌、真菌和植物的PG蛋白序列,用CLUSTALW程序对其氨基酸序列进行了联配,并用邻位相接法构建了系统进化树.结果表明,尽管不同来源的PG序列表现了很大的差异,但仍有4个保守性极强的结构域存在(~(175)NTD、~(197)DD、~(218)GHG和~(250)RIK);同时发现在PG序列中大多数的Cys 位点均具有较好的保守性,而且在细菌、真菌和植物的PG序列中各有自身保守的Cys位点,Cys的保守性体现了物种的分类关系;进一步构建分子进化树显示,PG基因基本上首先根据物种类型而聚类,明显地划分为细菌、真菌和植物三大类;其次,不同作用方式的内切PG(endo-PG)和外切PG(exo-PG)在各类群中也都处于完全独立的分支中.
다취반유당철산매(polygalacturonase,PG)엄범존재우세균、진균화식물중,목전수거고중이적루료대량적서렬자료.위료진일보료해PG기인가족적분자진화,이급기작위계통진화연구재료적가능성,본연구선취료88조래자불동물충포괄세균、진균화식물적PG단백서렬,용CLUSTALW정서대기안기산서렬진행료련배,병용린위상접법구건료계통진화수.결과표명,진관불동래원적PG서렬표현료흔대적차이,단잉유4개보수성겁강적결구역존재(~(175)NTD、~(197)DD、~(218)GHG화~(250)RIK);동시발현재PG서렬중대다수적Cys 위점균구유교호적보수성,이차재세균、진균화식물적PG서렬중각유자신보수적Cys위점,Cys적보수성체현료물충적분류관계;진일보구건분자진화수현시,PG기인기본상수선근거물충류형이취류,명현지화분위세균、진균화식물삼대류;기차,불동작용방식적내절PG(endo-PG)화외절PG(exo-PG)재각류군중야도처우완전독립적분지중.