高等学校化学学报
高等學校化學學報
고등학교화학학보
CHEMICAL JOURNAL OF CHINESE UNIVERSITIES
2010年
2期
336-342
,共7页
汪月鹏%王明安%杜凤沛%李向东%姚广伟%张潘丹%路慧哲
汪月鵬%王明安%杜鳳沛%李嚮東%姚廣偉%張潘丹%路慧哲
왕월붕%왕명안%두봉패%리향동%요엄위%장반단%로혜철
腺苷酸琥珀酸合成酶%抑制剂%分子对接%密度泛函理论
腺苷痠琥珀痠閤成酶%抑製劑%分子對接%密度汎函理論
선감산호박산합성매%억제제%분자대접%밀도범함이론
Adenylosuccinate synthetase(AdSS)%Inhibitor%Molecule docking%Density functional theory
利用密度泛函B3LYP方法选择6-31G(d)基组对腺苷酸琥珀酸合成酶(AdSS)天然抑制剂及其衍生物的结构进行优化, 并对其稳定性进行了分析, 同时采用Mulliken键序、原子电荷分布、表观静电势等对AdSS抑制剂及其衍生物电子结构与其生物活性相关性进行了理论研究. 基于腺苷酸琥珀酸合成酶(AdSS)与其底物肌苷单磷酸(IMP)复合物的晶体结构以及获得的天然抑制剂衍生物稳定构象, 利用分子对接、分子力学优化及常温分子动力学模拟对AdSS酶与天然抑制剂及其衍生物的相互作用复合物结构进行理论预测. 结果表明, AdSS酶的系列抑制剂中磷酸根基团和乙内酰脲(Hydantoin)官能团构成药效团模型, 识别过程中范德华相互作用能的贡献大于静电相互作用能.
利用密度汎函B3LYP方法選擇6-31G(d)基組對腺苷痠琥珀痠閤成酶(AdSS)天然抑製劑及其衍生物的結構進行優化, 併對其穩定性進行瞭分析, 同時採用Mulliken鍵序、原子電荷分佈、錶觀靜電勢等對AdSS抑製劑及其衍生物電子結構與其生物活性相關性進行瞭理論研究. 基于腺苷痠琥珀痠閤成酶(AdSS)與其底物肌苷單燐痠(IMP)複閤物的晶體結構以及穫得的天然抑製劑衍生物穩定構象, 利用分子對接、分子力學優化及常溫分子動力學模擬對AdSS酶與天然抑製劑及其衍生物的相互作用複閤物結構進行理論預測. 結果錶明, AdSS酶的繫列抑製劑中燐痠根基糰和乙內酰脲(Hydantoin)官能糰構成藥效糰模型, 識彆過程中範德華相互作用能的貢獻大于靜電相互作用能.
이용밀도범함B3LYP방법선택6-31G(d)기조대선감산호박산합성매(AdSS)천연억제제급기연생물적결구진행우화, 병대기은정성진행료분석, 동시채용Mulliken건서、원자전하분포、표관정전세등대AdSS억제제급기연생물전자결구여기생물활성상관성진행료이론연구. 기우선감산호박산합성매(AdSS)여기저물기감단린산(IMP)복합물적정체결구이급획득적천연억제제연생물은정구상, 이용분자대접、분자역학우화급상온분자동역학모의대AdSS매여천연억제제급기연생물적상호작용복합물결구진행이론예측. 결과표명, AdSS매적계렬억제제중린산근기단화을내선뇨(Hydantoin)관능단구성약효단모형, 식별과정중범덕화상호작용능적공헌대우정전상호작용능.
